Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MKRN4PQ13434 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MKRN4PQ13434 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MKRN4PQ13434 RTN1-203ENST00000395090 1609 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MKRN4PQ13434 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MKRN4PQ13434 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MKRN4PQ13434 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MKRN4PQ13434 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MKRN4PQ13434 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MKRN4PQ13434 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MKRN4PQ13434 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MKRN4PQ13434 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MKRN4PQ13434 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
MKRN4PQ13434 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MKRN4PQ13434 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
MKRN4PQ13434 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MKRN4PQ13434 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MKRN4PQ13434 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MKRN4PQ13434 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MKRN4PQ13434 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MKRN4PQ13434 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MKRN4PQ13434 AC092905.1-201ENST00000467527 949 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
MKRN4PQ13434 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MKRN4PQ13434 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MKRN4PQ13434 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
MKRN4PQ13434 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MKRN4PQ13434 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MKRN4PQ13434 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MKRN4PQ13434 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MKRN4PQ13434 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MKRN4PQ13434 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MKRN4PQ13434 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
MKRN4PQ13434 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
MKRN4PQ13434 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
MKRN4PQ13434 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
MKRN4PQ13434 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
MKRN4PQ13434 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
MKRN4PQ13434 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
MKRN4PQ13434 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
MKRN4PQ13434 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
MKRN4PQ13434 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
MKRN4PQ13434 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
MKRN4PQ13434 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
MKRN4PQ13434 AL390039.1-201ENST00000399148 611 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
MKRN4PQ13434 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
MKRN4PQ13434 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
MKRN4PQ13434 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
MKRN4PQ13434 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
MKRN4PQ13434 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
MKRN4PQ13434 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
MKRN4PQ13434 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
MKRN4PQ13434 LINC02274-201ENST00000555539 1174 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
MKRN4PQ13434 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
MKRN4PQ13434 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
MKRN4PQ13434 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
MKRN4PQ13434 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
MKRN4PQ13434 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
MKRN4PQ13434 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.84
MKRN4PQ13434 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
MKRN4PQ13434 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
MKRN4PQ13434 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
MKRN4PQ13434 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
MKRN4PQ13434 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
MKRN4PQ13434 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
MKRN4PQ13434 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
MKRN4PQ13434 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
MKRN4PQ13434 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
MKRN4PQ13434 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
MKRN4PQ13434 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
MKRN4PQ13434 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
MKRN4PQ13434 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
MKRN4PQ13434 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
MKRN4PQ13434 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
MKRN4PQ13434 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
MKRN4PQ13434 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
MKRN4PQ13434 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
MKRN4PQ13434 AC013470.3-201ENST00000420252 1194 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
MKRN4PQ13434 AC253576.1-201ENST00000511645 1156 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
MKRN4PQ13434 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
MKRN4PQ13434 AC016180.1-201ENST00000567945 403 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
MKRN4PQ13434 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
MKRN4PQ13434 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
MKRN4PQ13434 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
MKRN4PQ13434 AC004908.3-201ENST00000610248 625 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
MKRN4PQ13434 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
MKRN4PQ13434 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
MKRN4PQ13434 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
MKRN4PQ13434 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
MKRN4PQ13434 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
MKRN4PQ13434 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
MKRN4PQ13434 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
MKRN4PQ13434 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
MKRN4PQ13434 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
MKRN4PQ13434 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
MKRN4PQ13434 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MKRN4PQ13434 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MKRN4PQ13434 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MKRN4PQ13434 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
MKRN4PQ13434 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MKRN4PQ13434 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms