Protein–RNA interactions for Protein: Q13133

NR1H3, Oxysterols receptor LXR-alpha, humanhuman

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Length 447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1H3Q13133 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NR1H3Q13133 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NR1H3Q13133 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NR1H3Q13133 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NR1H3Q13133 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NR1H3Q13133 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
NR1H3Q13133 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NR1H3Q13133 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NR1H3Q13133 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NR1H3Q13133 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NR1H3Q13133 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NR1H3Q13133 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NR1H3Q13133 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NR1H3Q13133 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
NR1H3Q13133 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
NR1H3Q13133 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NR1H3Q13133 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NR1H3Q13133 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NR1H3Q13133 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NR1H3Q13133 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NR1H3Q13133 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NR1H3Q13133 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NR1H3Q13133 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NR1H3Q13133 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NR1H3Q13133 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NR1H3Q13133 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NR1H3Q13133 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NR1H3Q13133 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NR1H3Q13133 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NR1H3Q13133 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NR1H3Q13133 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NR1H3Q13133 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NR1H3Q13133 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NR1H3Q13133 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NR1H3Q13133 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NR1H3Q13133 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NR1H3Q13133 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NR1H3Q13133 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NR1H3Q13133 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NR1H3Q13133 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NR1H3Q13133 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NR1H3Q13133 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NR1H3Q13133 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NR1H3Q13133 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NR1H3Q13133 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NR1H3Q13133 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NR1H3Q13133 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NR1H3Q13133 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NR1H3Q13133 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
NR1H3Q13133 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NR1H3Q13133 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NR1H3Q13133 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NR1H3Q13133 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NR1H3Q13133 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NR1H3Q13133 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NR1H3Q13133 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NR1H3Q13133 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NR1H3Q13133 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NR1H3Q13133 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NR1H3Q13133 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NR1H3Q13133 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NR1H3Q13133 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NR1H3Q13133 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NR1H3Q13133 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NR1H3Q13133 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NR1H3Q13133 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
NR1H3Q13133 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
NR1H3Q13133 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NR1H3Q13133 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
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NR1H3Q13133 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
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NR1H3Q13133 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NR1H3Q13133 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NR1H3Q13133 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NR1H3Q13133 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NR1H3Q13133 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
NR1H3Q13133 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NR1H3Q13133 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NR1H3Q13133 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
NR1H3Q13133 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NR1H3Q13133 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NR1H3Q13133 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NR1H3Q13133 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NR1H3Q13133 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NR1H3Q13133 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NR1H3Q13133 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NR1H3Q13133 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NR1H3Q13133 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NR1H3Q13133 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NR1H3Q13133 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NR1H3Q13133 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
NR1H3Q13133 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NR1H3Q13133 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NR1H3Q13133 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
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