Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K0

NIPAL4, Magnesium transporter NIPA4, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPAL4Q0D2K0 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NIPAL4Q0D2K0 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NIPAL4Q0D2K0 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NIPAL4Q0D2K0 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NIPAL4Q0D2K0 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NIPAL4Q0D2K0 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NIPAL4Q0D2K0 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NIPAL4Q0D2K0 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NIPAL4Q0D2K0 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NIPAL4Q0D2K0 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NIPAL4Q0D2K0 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
NIPAL4Q0D2K0 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NIPAL4Q0D2K0 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NIPAL4Q0D2K0 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NIPAL4Q0D2K0 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NIPAL4Q0D2K0 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NIPAL4Q0D2K0 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NIPAL4Q0D2K0 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NIPAL4Q0D2K0 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NIPAL4Q0D2K0 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NIPAL4Q0D2K0 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NIPAL4Q0D2K0 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
NIPAL4Q0D2K0 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NIPAL4Q0D2K0 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NIPAL4Q0D2K0 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NIPAL4Q0D2K0 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NIPAL4Q0D2K0 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NIPAL4Q0D2K0 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NIPAL4Q0D2K0 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NIPAL4Q0D2K0 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NIPAL4Q0D2K0 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NIPAL4Q0D2K0 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NIPAL4Q0D2K0 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NIPAL4Q0D2K0 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NIPAL4Q0D2K0 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NIPAL4Q0D2K0 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NIPAL4Q0D2K0 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NIPAL4Q0D2K0 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
NIPAL4Q0D2K0 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NIPAL4Q0D2K0 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NIPAL4Q0D2K0 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NIPAL4Q0D2K0 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NIPAL4Q0D2K0 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
NIPAL4Q0D2K0 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NIPAL4Q0D2K0 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NIPAL4Q0D2K0 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NIPAL4Q0D2K0 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NIPAL4Q0D2K0 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NIPAL4Q0D2K0 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NIPAL4Q0D2K0 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NIPAL4Q0D2K0 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NIPAL4Q0D2K0 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NIPAL4Q0D2K0 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NIPAL4Q0D2K0 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NIPAL4Q0D2K0 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NIPAL4Q0D2K0 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NIPAL4Q0D2K0 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NIPAL4Q0D2K0 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NIPAL4Q0D2K0 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NIPAL4Q0D2K0 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NIPAL4Q0D2K0 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NIPAL4Q0D2K0 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NIPAL4Q0D2K0 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NIPAL4Q0D2K0 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NIPAL4Q0D2K0 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NIPAL4Q0D2K0 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NIPAL4Q0D2K0 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NIPAL4Q0D2K0 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NIPAL4Q0D2K0 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
NIPAL4Q0D2K0 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
NIPAL4Q0D2K0 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
NIPAL4Q0D2K0 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NIPAL4Q0D2K0 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NIPAL4Q0D2K0 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
NIPAL4Q0D2K0 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NIPAL4Q0D2K0 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NIPAL4Q0D2K0 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NIPAL4Q0D2K0 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NIPAL4Q0D2K0 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NIPAL4Q0D2K0 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NIPAL4Q0D2K0 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NIPAL4Q0D2K0 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NIPAL4Q0D2K0 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
NIPAL4Q0D2K0 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NIPAL4Q0D2K0 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NIPAL4Q0D2K0 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NIPAL4Q0D2K0 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NIPAL4Q0D2K0 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NIPAL4Q0D2K0 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NIPAL4Q0D2K0 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NIPAL4Q0D2K0 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NIPAL4Q0D2K0 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NIPAL4Q0D2K0 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NIPAL4Q0D2K0 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NIPAL4Q0D2K0 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NIPAL4Q0D2K0 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NIPAL4Q0D2K0 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NIPAL4Q0D2K0 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NIPAL4Q0D2K0 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NIPAL4Q0D2K0 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms