Protein–RNA interactions for Protein: Q05682

CALD1, Caldesmon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALD1Q05682 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CALD1Q05682 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CALD1Q05682 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CALD1Q05682 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CALD1Q05682 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CALD1Q05682 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CALD1Q05682 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CALD1Q05682 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CALD1Q05682 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CALD1Q05682 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CALD1Q05682 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CALD1Q05682 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CALD1Q05682 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CALD1Q05682 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CALD1Q05682 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CALD1Q05682 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CALD1Q05682 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CALD1Q05682 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CALD1Q05682 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CALD1Q05682 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CALD1Q05682 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CALD1Q05682 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CALD1Q05682 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CALD1Q05682 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CALD1Q05682 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CALD1Q05682 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CALD1Q05682 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CALD1Q05682 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CALD1Q05682 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CALD1Q05682 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CALD1Q05682 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CALD1Q05682 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CALD1Q05682 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CALD1Q05682 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CALD1Q05682 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CALD1Q05682 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CALD1Q05682 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CALD1Q05682 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CALD1Q05682 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CALD1Q05682 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CALD1Q05682 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CALD1Q05682 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CALD1Q05682 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CALD1Q05682 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CALD1Q05682 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CALD1Q05682 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CALD1Q05682 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CALD1Q05682 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CALD1Q05682 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CALD1Q05682 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CALD1Q05682 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CALD1Q05682 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CALD1Q05682 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CALD1Q05682 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CALD1Q05682 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CALD1Q05682 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CALD1Q05682 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CALD1Q05682 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CALD1Q05682 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CALD1Q05682 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CALD1Q05682 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CALD1Q05682 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CALD1Q05682 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CALD1Q05682 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CALD1Q05682 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CALD1Q05682 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CALD1Q05682 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CALD1Q05682 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CALD1Q05682 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CALD1Q05682 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CALD1Q05682 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CALD1Q05682 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CALD1Q05682 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CALD1Q05682 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CALD1Q05682 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CALD1Q05682 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CALD1Q05682 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CALD1Q05682 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CALD1Q05682 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CALD1Q05682 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CALD1Q05682 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CALD1Q05682 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CALD1Q05682 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CALD1Q05682 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CALD1Q05682 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CALD1Q05682 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CALD1Q05682 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CALD1Q05682 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CALD1Q05682 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CALD1Q05682 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CALD1Q05682 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CALD1Q05682 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CALD1Q05682 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CALD1Q05682 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CALD1Q05682 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CALD1Q05682 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CALD1Q05682 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CALD1Q05682 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CALD1Q05682 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CALD1Q05682 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms