Protein–RNA interactions for Protein: Q02556

IRF8, Interferon regulatory factor 8, humanhuman

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF8Q02556 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
IRF8Q02556 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
IRF8Q02556 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
IRF8Q02556 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
IRF8Q02556 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
IRF8Q02556 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
IRF8Q02556 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
IRF8Q02556 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
IRF8Q02556 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
IRF8Q02556 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
IRF8Q02556 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
IRF8Q02556 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
IRF8Q02556 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
IRF8Q02556 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
IRF8Q02556 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
IRF8Q02556 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
IRF8Q02556 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
IRF8Q02556 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
IRF8Q02556 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
IRF8Q02556 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
IRF8Q02556 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
IRF8Q02556 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
IRF8Q02556 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
IRF8Q02556 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
IRF8Q02556 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
IRF8Q02556 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
IRF8Q02556 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
IRF8Q02556 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
IRF8Q02556 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
IRF8Q02556 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
IRF8Q02556 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
IRF8Q02556 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
IRF8Q02556 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
IRF8Q02556 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
IRF8Q02556 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
IRF8Q02556 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
IRF8Q02556 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
IRF8Q02556 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
IRF8Q02556 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
IRF8Q02556 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
IRF8Q02556 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
IRF8Q02556 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
IRF8Q02556 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
IRF8Q02556 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
IRF8Q02556 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
IRF8Q02556 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
IRF8Q02556 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
IRF8Q02556 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
IRF8Q02556 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
IRF8Q02556 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
IRF8Q02556 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
IRF8Q02556 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
IRF8Q02556 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
IRF8Q02556 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
IRF8Q02556 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
IRF8Q02556 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
IRF8Q02556 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
IRF8Q02556 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
IRF8Q02556 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
IRF8Q02556 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
IRF8Q02556 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
IRF8Q02556 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
IRF8Q02556 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
IRF8Q02556 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
IRF8Q02556 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
IRF8Q02556 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
IRF8Q02556 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
IRF8Q02556 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
IRF8Q02556 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
IRF8Q02556 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
IRF8Q02556 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
IRF8Q02556 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
IRF8Q02556 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
IRF8Q02556 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
IRF8Q02556 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
IRF8Q02556 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
IRF8Q02556 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
IRF8Q02556 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
IRF8Q02556 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
IRF8Q02556 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
IRF8Q02556 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
IRF8Q02556 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
IRF8Q02556 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
IRF8Q02556 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
IRF8Q02556 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
IRF8Q02556 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
IRF8Q02556 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
IRF8Q02556 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
IRF8Q02556 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
IRF8Q02556 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
IRF8Q02556 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
IRF8Q02556 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
IRF8Q02556 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
IRF8Q02556 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
IRF8Q02556 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
IRF8Q02556 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
IRF8Q02556 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
IRF8Q02556 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
IRF8Q02556 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
IRF8Q02556 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.4 ms