Protein–RNA interactions for Protein: Q00597

FANCC, Fanconi anemia group C protein, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCCQ00597 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
FANCCQ00597 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
FANCCQ00597 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
FANCCQ00597 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
FANCCQ00597 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FANCCQ00597 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FANCCQ00597 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
FANCCQ00597 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FANCCQ00597 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
FANCCQ00597 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
FANCCQ00597 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FANCCQ00597 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
FANCCQ00597 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
FANCCQ00597 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
FANCCQ00597 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
FANCCQ00597 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
FANCCQ00597 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FANCCQ00597 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FANCCQ00597 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
FANCCQ00597 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FANCCQ00597 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
FANCCQ00597 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
FANCCQ00597 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FANCCQ00597 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
FANCCQ00597 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
FANCCQ00597 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FANCCQ00597 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FANCCQ00597 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
FANCCQ00597 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
FANCCQ00597 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
FANCCQ00597 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
FANCCQ00597 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
FANCCQ00597 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
FANCCQ00597 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
FANCCQ00597 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
FANCCQ00597 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
FANCCQ00597 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
FANCCQ00597 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
FANCCQ00597 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
FANCCQ00597 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
FANCCQ00597 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
FANCCQ00597 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
FANCCQ00597 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
FANCCQ00597 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
FANCCQ00597 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
FANCCQ00597 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
FANCCQ00597 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
FANCCQ00597 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
FANCCQ00597 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
FANCCQ00597 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
FANCCQ00597 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
FANCCQ00597 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
FANCCQ00597 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
FANCCQ00597 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
FANCCQ00597 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
FANCCQ00597 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
FANCCQ00597 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
FANCCQ00597 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FANCCQ00597 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
FANCCQ00597 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FANCCQ00597 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FANCCQ00597 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
FANCCQ00597 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FANCCQ00597 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FANCCQ00597 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FANCCQ00597 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FANCCQ00597 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FANCCQ00597 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
FANCCQ00597 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FANCCQ00597 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
FANCCQ00597 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FANCCQ00597 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FANCCQ00597 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FANCCQ00597 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
FANCCQ00597 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FANCCQ00597 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
FANCCQ00597 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
FANCCQ00597 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
FANCCQ00597 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FANCCQ00597 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
FANCCQ00597 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
FANCCQ00597 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FANCCQ00597 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
FANCCQ00597 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FANCCQ00597 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
FANCCQ00597 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FANCCQ00597 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FANCCQ00597 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FANCCQ00597 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
FANCCQ00597 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
FANCCQ00597 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FANCCQ00597 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
FANCCQ00597 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
FANCCQ00597 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FANCCQ00597 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
FANCCQ00597 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
FANCCQ00597 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FANCCQ00597 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
FANCCQ00597 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FANCCQ00597 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms