Protein–RNA interactions for Protein: Q00526

CDK3, Cyclin-dependent kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK3Q00526 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDK3Q00526 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDK3Q00526 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CDK3Q00526 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CDK3Q00526 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDK3Q00526 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDK3Q00526 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDK3Q00526 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDK3Q00526 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CDK3Q00526 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDK3Q00526 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDK3Q00526 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDK3Q00526 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDK3Q00526 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDK3Q00526 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDK3Q00526 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDK3Q00526 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDK3Q00526 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDK3Q00526 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDK3Q00526 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDK3Q00526 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDK3Q00526 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDK3Q00526 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDK3Q00526 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDK3Q00526 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDK3Q00526 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDK3Q00526 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDK3Q00526 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CDK3Q00526 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDK3Q00526 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDK3Q00526 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDK3Q00526 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDK3Q00526 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CDK3Q00526 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDK3Q00526 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CDK3Q00526 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDK3Q00526 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CDK3Q00526 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDK3Q00526 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDK3Q00526 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDK3Q00526 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDK3Q00526 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDK3Q00526 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDK3Q00526 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDK3Q00526 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDK3Q00526 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDK3Q00526 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDK3Q00526 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDK3Q00526 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDK3Q00526 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDK3Q00526 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDK3Q00526 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDK3Q00526 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDK3Q00526 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDK3Q00526 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDK3Q00526 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDK3Q00526 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDK3Q00526 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDK3Q00526 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CDK3Q00526 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDK3Q00526 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CDK3Q00526 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CDK3Q00526 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDK3Q00526 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDK3Q00526 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDK3Q00526 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDK3Q00526 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDK3Q00526 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDK3Q00526 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDK3Q00526 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDK3Q00526 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDK3Q00526 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDK3Q00526 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDK3Q00526 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDK3Q00526 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDK3Q00526 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CDK3Q00526 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDK3Q00526 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CDK3Q00526 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDK3Q00526 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDK3Q00526 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDK3Q00526 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDK3Q00526 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CDK3Q00526 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDK3Q00526 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDK3Q00526 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDK3Q00526 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDK3Q00526 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDK3Q00526 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDK3Q00526 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDK3Q00526 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDK3Q00526 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDK3Q00526 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDK3Q00526 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDK3Q00526 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDK3Q00526 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CDK3Q00526 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDK3Q00526 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDK3Q00526 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDK3Q00526 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms