Protein–RNA interactions for Protein: P62684

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P62684 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
HERVK_113P62684 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
HERVK_113P62684 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HERVK_113P62684 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
HERVK_113P62684 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
HERVK_113P62684 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
HERVK_113P62684 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
HERVK_113P62684 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
HERVK_113P62684 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HERVK_113P62684 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HERVK_113P62684 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.01■□□□□ 0.95
HERVK_113P62684 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
HERVK_113P62684 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HERVK_113P62684 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
HERVK_113P62684 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
HERVK_113P62684 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HERVK_113P62684 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
HERVK_113P62684 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HERVK_113P62684 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HERVK_113P62684 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
HERVK_113P62684 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HERVK_113P62684 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
HERVK_113P62684 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
HERVK_113P62684 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HERVK_113P62684 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
HERVK_113P62684 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HERVK_113P62684 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
HERVK_113P62684 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
HERVK_113P62684 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
HERVK_113P62684 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
HERVK_113P62684 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HERVK_113P62684 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HERVK_113P62684 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
HERVK_113P62684 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HERVK_113P62684 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HERVK_113P62684 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HERVK_113P62684 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HERVK_113P62684 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
HERVK_113P62684 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
HERVK_113P62684 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HERVK_113P62684 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HERVK_113P62684 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
HERVK_113P62684 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HERVK_113P62684 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HERVK_113P62684 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HERVK_113P62684 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HERVK_113P62684 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HERVK_113P62684 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC21■□□□□ 0.95
HERVK_113P62684 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HERVK_113P62684 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
HERVK_113P62684 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HERVK_113P62684 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
HERVK_113P62684 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HERVK_113P62684 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC21■□□□□ 0.95
HERVK_113P62684 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
HERVK_113P62684 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC21■□□□□ 0.95
HERVK_113P62684 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC21■□□□□ 0.95
HERVK_113P62684 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC21■□□□□ 0.95
HERVK_113P62684 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
HERVK_113P62684 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
HERVK_113P62684 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
HERVK_113P62684 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HERVK_113P62684 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HERVK_113P62684 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HERVK_113P62684 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HERVK_113P62684 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
HERVK_113P62684 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
HERVK_113P62684 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HERVK_113P62684 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HERVK_113P62684 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HERVK_113P62684 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
HERVK_113P62684 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
HERVK_113P62684 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
HERVK_113P62684 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
HERVK_113P62684 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
HERVK_113P62684 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
HERVK_113P62684 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
HERVK_113P62684 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
HERVK_113P62684 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
HERVK_113P62684 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
HERVK_113P62684 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
HERVK_113P62684 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
HERVK_113P62684 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
HERVK_113P62684 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
HERVK_113P62684 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
HERVK_113P62684 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
HERVK_113P62684 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC20.99■□□□□ 0.95
HERVK_113P62684 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
HERVK_113P62684 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
HERVK_113P62684 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
HERVK_113P62684 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
HERVK_113P62684 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
HERVK_113P62684 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
HERVK_113P62684 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
HERVK_113P62684 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
HERVK_113P62684 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
HERVK_113P62684 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
HERVK_113P62684 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
HERVK_113P62684 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
HERVK_113P62684 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms