Protein–RNA interactions for Protein: P61960

UFM1, Ubiquitin-fold modifier 1, humanhuman

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFM1P61960 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
UFM1P61960 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
UFM1P61960 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
UFM1P61960 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
UFM1P61960 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
UFM1P61960 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
UFM1P61960 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
UFM1P61960 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
UFM1P61960 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
UFM1P61960 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
UFM1P61960 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
UFM1P61960 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
UFM1P61960 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
UFM1P61960 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
UFM1P61960 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
UFM1P61960 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
UFM1P61960 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
UFM1P61960 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
UFM1P61960 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
UFM1P61960 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
UFM1P61960 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
UFM1P61960 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
UFM1P61960 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
UFM1P61960 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
UFM1P61960 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
UFM1P61960 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
UFM1P61960 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
UFM1P61960 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
UFM1P61960 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
UFM1P61960 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
UFM1P61960 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
UFM1P61960 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
UFM1P61960 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
UFM1P61960 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
UFM1P61960 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
UFM1P61960 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
UFM1P61960 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
UFM1P61960 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
UFM1P61960 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
UFM1P61960 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
UFM1P61960 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
UFM1P61960 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
UFM1P61960 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
UFM1P61960 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
UFM1P61960 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
UFM1P61960 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
UFM1P61960 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
UFM1P61960 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
UFM1P61960 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
UFM1P61960 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
UFM1P61960 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
UFM1P61960 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
UFM1P61960 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
UFM1P61960 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
UFM1P61960 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
UFM1P61960 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
UFM1P61960 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
UFM1P61960 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
UFM1P61960 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
UFM1P61960 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
UFM1P61960 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
UFM1P61960 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
UFM1P61960 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
UFM1P61960 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
UFM1P61960 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
UFM1P61960 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
UFM1P61960 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
UFM1P61960 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
UFM1P61960 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
UFM1P61960 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
UFM1P61960 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
UFM1P61960 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
UFM1P61960 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
UFM1P61960 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
UFM1P61960 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
UFM1P61960 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
UFM1P61960 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
UFM1P61960 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
UFM1P61960 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
UFM1P61960 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
UFM1P61960 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
UFM1P61960 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
UFM1P61960 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
UFM1P61960 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
UFM1P61960 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
UFM1P61960 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
UFM1P61960 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
UFM1P61960 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
UFM1P61960 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
UFM1P61960 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
UFM1P61960 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
UFM1P61960 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
UFM1P61960 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
UFM1P61960 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
UFM1P61960 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
UFM1P61960 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
UFM1P61960 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
UFM1P61960 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
UFM1P61960 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
UFM1P61960 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.2 ms