Protein–RNA interactions for Protein: P48163

ME1, NADP-dependent malic enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME1P48163 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ME1P48163 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ME1P48163 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ME1P48163 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ME1P48163 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ME1P48163 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ME1P48163 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
ME1P48163 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
ME1P48163 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ME1P48163 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ME1P48163 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ME1P48163 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ME1P48163 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ME1P48163 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ME1P48163 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ME1P48163 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ME1P48163 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ME1P48163 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ME1P48163 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ME1P48163 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ME1P48163 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ME1P48163 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ME1P48163 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ME1P48163 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ME1P48163 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ME1P48163 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ME1P48163 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ME1P48163 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ME1P48163 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ME1P48163 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ME1P48163 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ME1P48163 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ME1P48163 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ME1P48163 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
ME1P48163 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ME1P48163 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ME1P48163 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ME1P48163 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
ME1P48163 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ME1P48163 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ME1P48163 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ME1P48163 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ME1P48163 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ME1P48163 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ME1P48163 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ME1P48163 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ME1P48163 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ME1P48163 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ME1P48163 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ME1P48163 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ME1P48163 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ME1P48163 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ME1P48163 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ME1P48163 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ME1P48163 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
ME1P48163 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ME1P48163 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ME1P48163 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ME1P48163 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ME1P48163 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ME1P48163 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ME1P48163 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ME1P48163 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ME1P48163 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ME1P48163 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ME1P48163 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ME1P48163 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ME1P48163 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
ME1P48163 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ME1P48163 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
ME1P48163 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ME1P48163 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ME1P48163 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ME1P48163 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ME1P48163 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ME1P48163 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ME1P48163 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ME1P48163 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ME1P48163 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ME1P48163 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ME1P48163 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ME1P48163 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ME1P48163 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ME1P48163 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ME1P48163 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ME1P48163 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ME1P48163 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ME1P48163 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ME1P48163 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ME1P48163 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ME1P48163 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ME1P48163 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ME1P48163 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ME1P48163 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ME1P48163 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ME1P48163 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ME1P48163 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ME1P48163 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ME1P48163 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ME1P48163 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms