Protein–RNA interactions for Protein: P46060

RANGAP1, Ran GTPase-activating protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 587 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RANGAP1P46060 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
RANGAP1P46060 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
RANGAP1P46060 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
RANGAP1P46060 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
RANGAP1P46060 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
RANGAP1P46060 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
RANGAP1P46060 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
RANGAP1P46060 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
RANGAP1P46060 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
RANGAP1P46060 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
RANGAP1P46060 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
RANGAP1P46060 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
RANGAP1P46060 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
RANGAP1P46060 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
RANGAP1P46060 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
RANGAP1P46060 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
RANGAP1P46060 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
RANGAP1P46060 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
RANGAP1P46060 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
RANGAP1P46060 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
RANGAP1P46060 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
RANGAP1P46060 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
RANGAP1P46060 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
RANGAP1P46060 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
RANGAP1P46060 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
RANGAP1P46060 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
RANGAP1P46060 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
RANGAP1P46060 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
RANGAP1P46060 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.08■■■□□ 2.25
RANGAP1P46060 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
RANGAP1P46060 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
RANGAP1P46060 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
RANGAP1P46060 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
RANGAP1P46060 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
RANGAP1P46060 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
RANGAP1P46060 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
RANGAP1P46060 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
RANGAP1P46060 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC29.08■■■□□ 2.25
RANGAP1P46060 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
RANGAP1P46060 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
RANGAP1P46060 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
RANGAP1P46060 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
RANGAP1P46060 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
RANGAP1P46060 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
RANGAP1P46060 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
RANGAP1P46060 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
RANGAP1P46060 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
RANGAP1P46060 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
RANGAP1P46060 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
RANGAP1P46060 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
RANGAP1P46060 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
RANGAP1P46060 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
RANGAP1P46060 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
RANGAP1P46060 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
RANGAP1P46060 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
RANGAP1P46060 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
RANGAP1P46060 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
RANGAP1P46060 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
RANGAP1P46060 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
RANGAP1P46060 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
RANGAP1P46060 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
RANGAP1P46060 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
RANGAP1P46060 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
RANGAP1P46060 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
RANGAP1P46060 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC29.07■■■□□ 2.24
RANGAP1P46060 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
RANGAP1P46060 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
RANGAP1P46060 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
RANGAP1P46060 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
RANGAP1P46060 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
RANGAP1P46060 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
RANGAP1P46060 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
RANGAP1P46060 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
RANGAP1P46060 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
RANGAP1P46060 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
RANGAP1P46060 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
RANGAP1P46060 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
RANGAP1P46060 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
RANGAP1P46060 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
RANGAP1P46060 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
RANGAP1P46060 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
RANGAP1P46060 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
RANGAP1P46060 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
RANGAP1P46060 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
RANGAP1P46060 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
RANGAP1P46060 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
RANGAP1P46060 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
RANGAP1P46060 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC29.06■■■□□ 2.24
RANGAP1P46060 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC29.06■■■□□ 2.24
RANGAP1P46060 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
RANGAP1P46060 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
RANGAP1P46060 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
RANGAP1P46060 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
RANGAP1P46060 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
RANGAP1P46060 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
RANGAP1P46060 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
RANGAP1P46060 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
RANGAP1P46060 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
RANGAP1P46060 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC29.05■■■□□ 2.24
RANGAP1P46060 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms