Protein–RNA interactions for Protein: P41222

PTGDS, Prostaglandin-H2 D-isomerase, humanhuman

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGDSP41222 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTGDSP41222 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTGDSP41222 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTGDSP41222 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTGDSP41222 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTGDSP41222 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTGDSP41222 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTGDSP41222 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTGDSP41222 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTGDSP41222 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTGDSP41222 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTGDSP41222 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PTGDSP41222 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTGDSP41222 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTGDSP41222 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PTGDSP41222 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTGDSP41222 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTGDSP41222 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTGDSP41222 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTGDSP41222 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTGDSP41222 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTGDSP41222 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTGDSP41222 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTGDSP41222 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTGDSP41222 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTGDSP41222 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTGDSP41222 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTGDSP41222 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTGDSP41222 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTGDSP41222 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTGDSP41222 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTGDSP41222 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTGDSP41222 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PTGDSP41222 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTGDSP41222 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTGDSP41222 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTGDSP41222 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTGDSP41222 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTGDSP41222 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTGDSP41222 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PTGDSP41222 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTGDSP41222 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTGDSP41222 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTGDSP41222 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTGDSP41222 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTGDSP41222 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTGDSP41222 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTGDSP41222 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTGDSP41222 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTGDSP41222 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTGDSP41222 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTGDSP41222 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTGDSP41222 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTGDSP41222 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTGDSP41222 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTGDSP41222 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTGDSP41222 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PTGDSP41222 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTGDSP41222 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTGDSP41222 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTGDSP41222 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTGDSP41222 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTGDSP41222 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTGDSP41222 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PTGDSP41222 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTGDSP41222 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTGDSP41222 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTGDSP41222 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTGDSP41222 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTGDSP41222 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTGDSP41222 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTGDSP41222 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PTGDSP41222 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTGDSP41222 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTGDSP41222 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTGDSP41222 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTGDSP41222 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTGDSP41222 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTGDSP41222 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTGDSP41222 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTGDSP41222 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTGDSP41222 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTGDSP41222 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTGDSP41222 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTGDSP41222 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTGDSP41222 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTGDSP41222 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTGDSP41222 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTGDSP41222 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTGDSP41222 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTGDSP41222 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTGDSP41222 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTGDSP41222 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTGDSP41222 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTGDSP41222 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTGDSP41222 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTGDSP41222 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTGDSP41222 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTGDSP41222 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTGDSP41222 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms