Protein–RNA interactions for Protein: P36954

POLR2I, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2IP36954 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
POLR2IP36954 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
POLR2IP36954 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
POLR2IP36954 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
POLR2IP36954 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
POLR2IP36954 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
POLR2IP36954 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
POLR2IP36954 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
POLR2IP36954 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
POLR2IP36954 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
POLR2IP36954 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
POLR2IP36954 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
POLR2IP36954 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
POLR2IP36954 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
POLR2IP36954 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
POLR2IP36954 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
POLR2IP36954 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
POLR2IP36954 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
POLR2IP36954 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
POLR2IP36954 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
POLR2IP36954 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
POLR2IP36954 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
POLR2IP36954 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
POLR2IP36954 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
POLR2IP36954 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
POLR2IP36954 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
POLR2IP36954 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
POLR2IP36954 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
POLR2IP36954 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
POLR2IP36954 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
POLR2IP36954 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
POLR2IP36954 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
POLR2IP36954 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
POLR2IP36954 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
POLR2IP36954 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
POLR2IP36954 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
POLR2IP36954 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
POLR2IP36954 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
POLR2IP36954 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
POLR2IP36954 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
POLR2IP36954 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
POLR2IP36954 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
POLR2IP36954 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
POLR2IP36954 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
POLR2IP36954 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
POLR2IP36954 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
POLR2IP36954 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
POLR2IP36954 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
POLR2IP36954 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
POLR2IP36954 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
POLR2IP36954 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
POLR2IP36954 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
POLR2IP36954 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
POLR2IP36954 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
POLR2IP36954 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
POLR2IP36954 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
POLR2IP36954 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
POLR2IP36954 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
POLR2IP36954 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
POLR2IP36954 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
POLR2IP36954 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
POLR2IP36954 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
POLR2IP36954 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
POLR2IP36954 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
POLR2IP36954 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
POLR2IP36954 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
POLR2IP36954 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
POLR2IP36954 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
POLR2IP36954 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
POLR2IP36954 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
POLR2IP36954 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
POLR2IP36954 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
POLR2IP36954 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
POLR2IP36954 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
POLR2IP36954 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
POLR2IP36954 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
POLR2IP36954 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
POLR2IP36954 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
POLR2IP36954 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
POLR2IP36954 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
POLR2IP36954 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
POLR2IP36954 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
POLR2IP36954 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
POLR2IP36954 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
POLR2IP36954 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
POLR2IP36954 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
POLR2IP36954 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
POLR2IP36954 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
POLR2IP36954 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
POLR2IP36954 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
POLR2IP36954 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
POLR2IP36954 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
POLR2IP36954 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
POLR2IP36954 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
POLR2IP36954 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
POLR2IP36954 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
POLR2IP36954 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
POLR2IP36954 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
POLR2IP36954 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
POLR2IP36954 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms