Protein–RNA interactions for Protein: P31415

CASQ1, Calsequestrin-1, humanhuman

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1P31415 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
CASQ1P31415 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CASQ1P31415 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CASQ1P31415 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CASQ1P31415 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CASQ1P31415 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
CASQ1P31415 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CASQ1P31415 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CASQ1P31415 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CASQ1P31415 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CASQ1P31415 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CASQ1P31415 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CASQ1P31415 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
CASQ1P31415 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
CASQ1P31415 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
CASQ1P31415 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
CASQ1P31415 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CASQ1P31415 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CASQ1P31415 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CASQ1P31415 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CASQ1P31415 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CASQ1P31415 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CASQ1P31415 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CASQ1P31415 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CASQ1P31415 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CASQ1P31415 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CASQ1P31415 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CASQ1P31415 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CASQ1P31415 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CASQ1P31415 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CASQ1P31415 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CASQ1P31415 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CASQ1P31415 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CASQ1P31415 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CASQ1P31415 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CASQ1P31415 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CASQ1P31415 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CASQ1P31415 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CASQ1P31415 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CASQ1P31415 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CASQ1P31415 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CASQ1P31415 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CASQ1P31415 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CASQ1P31415 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CASQ1P31415 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CASQ1P31415 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CASQ1P31415 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CASQ1P31415 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CASQ1P31415 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CASQ1P31415 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CASQ1P31415 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CASQ1P31415 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CASQ1P31415 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CASQ1P31415 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CASQ1P31415 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CASQ1P31415 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CASQ1P31415 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CASQ1P31415 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CASQ1P31415 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CASQ1P31415 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CASQ1P31415 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CASQ1P31415 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CASQ1P31415 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
CASQ1P31415 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CASQ1P31415 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CASQ1P31415 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CASQ1P31415 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CASQ1P31415 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CASQ1P31415 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CASQ1P31415 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CASQ1P31415 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CASQ1P31415 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CASQ1P31415 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CASQ1P31415 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CASQ1P31415 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CASQ1P31415 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CASQ1P31415 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CASQ1P31415 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CASQ1P31415 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CASQ1P31415 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CASQ1P31415 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CASQ1P31415 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CASQ1P31415 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CASQ1P31415 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CASQ1P31415 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CASQ1P31415 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CASQ1P31415 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CASQ1P31415 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CASQ1P31415 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CASQ1P31415 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CASQ1P31415 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CASQ1P31415 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CASQ1P31415 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CASQ1P31415 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CASQ1P31415 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CASQ1P31415 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CASQ1P31415 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CASQ1P31415 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CASQ1P31415 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CASQ1P31415 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
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