Protein–RNA interactions for Protein: P29965

CD40LG, CD40 ligand, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD40LGP29965 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD40LGP29965 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD40LGP29965 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD40LGP29965 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD40LGP29965 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD40LGP29965 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD40LGP29965 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD40LGP29965 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD40LGP29965 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD40LGP29965 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD40LGP29965 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD40LGP29965 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD40LGP29965 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD40LGP29965 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD40LGP29965 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD40LGP29965 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD40LGP29965 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD40LGP29965 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CD40LGP29965 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD40LGP29965 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD40LGP29965 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD40LGP29965 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD40LGP29965 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD40LGP29965 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD40LGP29965 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CD40LGP29965 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD40LGP29965 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD40LGP29965 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD40LGP29965 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD40LGP29965 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD40LGP29965 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD40LGP29965 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD40LGP29965 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD40LGP29965 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD40LGP29965 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD40LGP29965 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD40LGP29965 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD40LGP29965 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD40LGP29965 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD40LGP29965 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD40LGP29965 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD40LGP29965 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD40LGP29965 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD40LGP29965 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD40LGP29965 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD40LGP29965 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD40LGP29965 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD40LGP29965 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD40LGP29965 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD40LGP29965 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CD40LGP29965 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CD40LGP29965 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CD40LGP29965 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD40LGP29965 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CD40LGP29965 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD40LGP29965 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD40LGP29965 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD40LGP29965 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CD40LGP29965 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD40LGP29965 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD40LGP29965 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD40LGP29965 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD40LGP29965 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD40LGP29965 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD40LGP29965 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD40LGP29965 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD40LGP29965 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD40LGP29965 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD40LGP29965 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD40LGP29965 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD40LGP29965 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD40LGP29965 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD40LGP29965 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD40LGP29965 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD40LGP29965 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD40LGP29965 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD40LGP29965 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD40LGP29965 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CD40LGP29965 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD40LGP29965 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD40LGP29965 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD40LGP29965 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD40LGP29965 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD40LGP29965 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD40LGP29965 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD40LGP29965 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD40LGP29965 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD40LGP29965 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD40LGP29965 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD40LGP29965 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CD40LGP29965 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CD40LGP29965 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD40LGP29965 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD40LGP29965 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD40LGP29965 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD40LGP29965 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD40LGP29965 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD40LGP29965 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD40LGP29965 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD40LGP29965 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms