Protein–RNA interactions for Protein: P25054

APC, Adenomatous polyposis coli protein, humanhuman

Predictions only

Length 2,843 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APCP25054 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
APCP25054 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
APCP25054 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
APCP25054 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
APCP25054 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
APCP25054 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
APCP25054 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
APCP25054 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
APCP25054 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
APCP25054 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
APCP25054 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
APCP25054 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
APCP25054 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
APCP25054 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
APCP25054 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
APCP25054 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
APCP25054 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
APCP25054 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
APCP25054 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
APCP25054 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
APCP25054 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
APCP25054 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
APCP25054 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
APCP25054 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
APCP25054 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
APCP25054 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
APCP25054 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
APCP25054 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
APCP25054 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
APCP25054 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
APCP25054 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
APCP25054 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
APCP25054 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
APCP25054 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
APCP25054 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
APCP25054 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
APCP25054 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
APCP25054 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
APCP25054 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
APCP25054 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
APCP25054 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
APCP25054 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
APCP25054 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
APCP25054 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
APCP25054 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
APCP25054 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
APCP25054 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
APCP25054 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
APCP25054 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
APCP25054 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
APCP25054 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
APCP25054 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
APCP25054 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
APCP25054 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
APCP25054 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
APCP25054 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
APCP25054 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
APCP25054 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
APCP25054 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
APCP25054 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
APCP25054 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
APCP25054 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
APCP25054 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
APCP25054 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
APCP25054 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
APCP25054 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
APCP25054 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
APCP25054 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
APCP25054 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
APCP25054 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
APCP25054 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
APCP25054 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
APCP25054 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
APCP25054 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
APCP25054 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
APCP25054 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
APCP25054 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
APCP25054 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
APCP25054 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
APCP25054 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
APCP25054 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
APCP25054 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
APCP25054 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
APCP25054 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
APCP25054 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
APCP25054 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
APCP25054 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
APCP25054 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
APCP25054 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
APCP25054 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
APCP25054 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
APCP25054 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
APCP25054 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
APCP25054 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
APCP25054 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
APCP25054 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
APCP25054 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
APCP25054 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
APCP25054 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
APCP25054 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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