Protein–RNA interactions for Protein: P22415

USF1, Upstream stimulatory factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 310 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF1P22415 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
USF1P22415 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
USF1P22415 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
USF1P22415 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
USF1P22415 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
USF1P22415 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
USF1P22415 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
USF1P22415 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
USF1P22415 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
USF1P22415 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
USF1P22415 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
USF1P22415 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
USF1P22415 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
USF1P22415 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
USF1P22415 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
USF1P22415 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
USF1P22415 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
USF1P22415 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
USF1P22415 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
USF1P22415 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
USF1P22415 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
USF1P22415 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
USF1P22415 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
USF1P22415 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
USF1P22415 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
USF1P22415 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
USF1P22415 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
USF1P22415 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
USF1P22415 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
USF1P22415 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
USF1P22415 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
USF1P22415 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
USF1P22415 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
USF1P22415 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
USF1P22415 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
USF1P22415 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
USF1P22415 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
USF1P22415 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
USF1P22415 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
USF1P22415 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
USF1P22415 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
USF1P22415 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
USF1P22415 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
USF1P22415 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
USF1P22415 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
USF1P22415 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
USF1P22415 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
USF1P22415 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
USF1P22415 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
USF1P22415 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
USF1P22415 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
USF1P22415 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
USF1P22415 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
USF1P22415 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
USF1P22415 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
USF1P22415 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
USF1P22415 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
USF1P22415 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
USF1P22415 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
USF1P22415 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
USF1P22415 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
USF1P22415 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
USF1P22415 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
USF1P22415 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
USF1P22415 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
USF1P22415 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
USF1P22415 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
USF1P22415 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
USF1P22415 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
USF1P22415 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
USF1P22415 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
USF1P22415 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
USF1P22415 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
USF1P22415 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
USF1P22415 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
USF1P22415 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
USF1P22415 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
USF1P22415 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
USF1P22415 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
USF1P22415 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
USF1P22415 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
USF1P22415 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
USF1P22415 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
USF1P22415 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
USF1P22415 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
USF1P22415 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
USF1P22415 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
USF1P22415 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
USF1P22415 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
USF1P22415 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
USF1P22415 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
USF1P22415 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
USF1P22415 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
USF1P22415 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
USF1P22415 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
USF1P22415 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
USF1P22415 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
USF1P22415 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
USF1P22415 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
USF1P22415 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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