Protein–RNA interactions for Protein: P20618

PSMB1, Proteasome subunit beta type-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB1P20618 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
PSMB1P20618 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PSMB1P20618 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PSMB1P20618 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PSMB1P20618 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PSMB1P20618 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PSMB1P20618 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PSMB1P20618 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PSMB1P20618 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
PSMB1P20618 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PSMB1P20618 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PSMB1P20618 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PSMB1P20618 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PSMB1P20618 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PSMB1P20618 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PSMB1P20618 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PSMB1P20618 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PSMB1P20618 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PSMB1P20618 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PSMB1P20618 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PSMB1P20618 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PSMB1P20618 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
PSMB1P20618 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
PSMB1P20618 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSMB1P20618 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSMB1P20618 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSMB1P20618 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSMB1P20618 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSMB1P20618 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSMB1P20618 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSMB1P20618 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSMB1P20618 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSMB1P20618 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSMB1P20618 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSMB1P20618 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSMB1P20618 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PSMB1P20618 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PSMB1P20618 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSMB1P20618 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSMB1P20618 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSMB1P20618 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PSMB1P20618 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PSMB1P20618 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSMB1P20618 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSMB1P20618 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSMB1P20618 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSMB1P20618 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSMB1P20618 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSMB1P20618 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSMB1P20618 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSMB1P20618 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSMB1P20618 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSMB1P20618 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSMB1P20618 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSMB1P20618 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSMB1P20618 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSMB1P20618 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSMB1P20618 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSMB1P20618 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSMB1P20618 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSMB1P20618 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSMB1P20618 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSMB1P20618 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSMB1P20618 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSMB1P20618 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSMB1P20618 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSMB1P20618 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSMB1P20618 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSMB1P20618 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSMB1P20618 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSMB1P20618 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSMB1P20618 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSMB1P20618 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSMB1P20618 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSMB1P20618 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSMB1P20618 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PSMB1P20618 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSMB1P20618 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSMB1P20618 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSMB1P20618 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSMB1P20618 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSMB1P20618 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PSMB1P20618 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSMB1P20618 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PSMB1P20618 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PSMB1P20618 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSMB1P20618 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSMB1P20618 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSMB1P20618 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSMB1P20618 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSMB1P20618 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSMB1P20618 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSMB1P20618 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSMB1P20618 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSMB1P20618 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSMB1P20618 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSMB1P20618 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSMB1P20618 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSMB1P20618 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PSMB1P20618 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms