Protein–RNA interactions for Protein: P0CW27

CCDC166, Coiled-coil domain-containing protein 166, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC166P0CW27 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC166P0CW27 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC166P0CW27 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC166P0CW27 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC166P0CW27 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC166P0CW27 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC166P0CW27 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC166P0CW27 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC166P0CW27 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC166P0CW27 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC166P0CW27 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC166P0CW27 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC166P0CW27 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC166P0CW27 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC166P0CW27 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC166P0CW27 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC166P0CW27 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC166P0CW27 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC166P0CW27 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC166P0CW27 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC166P0CW27 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC166P0CW27 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC166P0CW27 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC166P0CW27 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC166P0CW27 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC166P0CW27 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC166P0CW27 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC166P0CW27 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC166P0CW27 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC166P0CW27 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC166P0CW27 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC166P0CW27 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC166P0CW27 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC166P0CW27 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC166P0CW27 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC166P0CW27 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC166P0CW27 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC166P0CW27 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC166P0CW27 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC166P0CW27 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC166P0CW27 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC166P0CW27 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC166P0CW27 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC166P0CW27 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC166P0CW27 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC166P0CW27 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC166P0CW27 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC166P0CW27 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC166P0CW27 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC166P0CW27 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC166P0CW27 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC166P0CW27 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC166P0CW27 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC166P0CW27 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC166P0CW27 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC166P0CW27 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC166P0CW27 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC166P0CW27 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC166P0CW27 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC166P0CW27 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC166P0CW27 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC166P0CW27 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC166P0CW27 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC166P0CW27 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC166P0CW27 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC166P0CW27 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC166P0CW27 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC166P0CW27 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC166P0CW27 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC166P0CW27 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC166P0CW27 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC166P0CW27 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC166P0CW27 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC166P0CW27 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC166P0CW27 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC166P0CW27 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC166P0CW27 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC166P0CW27 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC166P0CW27 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC166P0CW27 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC166P0CW27 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC166P0CW27 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC166P0CW27 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC166P0CW27 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC166P0CW27 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC166P0CW27 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC166P0CW27 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC166P0CW27 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC166P0CW27 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC166P0CW27 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC166P0CW27 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC166P0CW27 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC166P0CW27 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC166P0CW27 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC166P0CW27 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC166P0CW27 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC166P0CW27 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC166P0CW27 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC166P0CW27 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC166P0CW27 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms