Protein–RNA interactions for Protein: P08F94

PKHD1, Fibrocystin, humanhuman

Predictions only

Length 4,074 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1P08F94 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
PKHD1P08F94 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PKHD1P08F94 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PKHD1P08F94 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PKHD1P08F94 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PKHD1P08F94 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
PKHD1P08F94 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
PKHD1P08F94 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
PKHD1P08F94 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
PKHD1P08F94 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
PKHD1P08F94 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC11.57□□□□□ -0.56
PKHD1P08F94 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
PKHD1P08F94 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
PKHD1P08F94 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
PKHD1P08F94 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
PKHD1P08F94 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
PKHD1P08F94 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC11.57□□□□□ -0.56
PKHD1P08F94 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
PKHD1P08F94 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
PKHD1P08F94 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
PKHD1P08F94 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
PKHD1P08F94 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
PKHD1P08F94 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
PKHD1P08F94 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
PKHD1P08F94 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
PKHD1P08F94 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
PKHD1P08F94 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
PKHD1P08F94 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
PKHD1P08F94 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
PKHD1P08F94 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
PKHD1P08F94 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
PKHD1P08F94 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
PKHD1P08F94 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
PKHD1P08F94 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
PKHD1P08F94 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC11.57□□□□□ -0.56
PKHD1P08F94 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
PKHD1P08F94 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
PKHD1P08F94 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
PKHD1P08F94 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
PKHD1P08F94 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
PKHD1P08F94 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PKHD1P08F94 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
PKHD1P08F94 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
PKHD1P08F94 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
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PKHD1P08F94 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
PKHD1P08F94 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PKHD1P08F94 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
PKHD1P08F94 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PKHD1P08F94 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PKHD1P08F94 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PKHD1P08F94 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PKHD1P08F94 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
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PKHD1P08F94 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PKHD1P08F94 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
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PKHD1P08F94 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
PKHD1P08F94 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
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PKHD1P08F94 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PKHD1P08F94 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PKHD1P08F94 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
PKHD1P08F94 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
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PKHD1P08F94 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PKHD1P08F94 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PKHD1P08F94 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC11.56□□□□□ -0.56
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PKHD1P08F94 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PKHD1P08F94 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
PKHD1P08F94 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
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PKHD1P08F94 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PKHD1P08F94 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PKHD1P08F94 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PKHD1P08F94 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
PKHD1P08F94 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
PKHD1P08F94 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
PKHD1P08F94 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
PKHD1P08F94 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
PKHD1P08F94 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
PKHD1P08F94 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
PKHD1P08F94 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
PKHD1P08F94 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
PKHD1P08F94 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
PKHD1P08F94 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
PKHD1P08F94 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
PKHD1P08F94 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
PKHD1P08F94 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
PKHD1P08F94 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
PKHD1P08F94 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
PKHD1P08F94 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
PKHD1P08F94 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
PKHD1P08F94 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
PKHD1P08F94 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
PKHD1P08F94 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
PKHD1P08F94 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
PKHD1P08F94 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
PKHD1P08F94 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
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