Protein–RNA interactions for Protein: P08648

ITGA5, Integrin alpha-5, humanhuman

Predictions only

Length 1,049 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA5P08648 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ITGA5P08648 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ITGA5P08648 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ITGA5P08648 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ITGA5P08648 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ITGA5P08648 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ITGA5P08648 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ITGA5P08648 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ITGA5P08648 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
ITGA5P08648 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ITGA5P08648 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ITGA5P08648 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ITGA5P08648 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ITGA5P08648 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ITGA5P08648 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ITGA5P08648 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ITGA5P08648 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ITGA5P08648 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ITGA5P08648 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ITGA5P08648 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ITGA5P08648 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ITGA5P08648 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ITGA5P08648 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ITGA5P08648 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ITGA5P08648 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ITGA5P08648 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ITGA5P08648 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ITGA5P08648 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ITGA5P08648 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ITGA5P08648 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ITGA5P08648 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ITGA5P08648 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ITGA5P08648 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ITGA5P08648 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ITGA5P08648 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ITGA5P08648 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ITGA5P08648 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ITGA5P08648 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ITGA5P08648 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ITGA5P08648 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ITGA5P08648 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ITGA5P08648 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ITGA5P08648 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ITGA5P08648 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ITGA5P08648 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ITGA5P08648 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ITGA5P08648 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ITGA5P08648 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ITGA5P08648 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ITGA5P08648 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ITGA5P08648 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ITGA5P08648 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ITGA5P08648 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ITGA5P08648 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ITGA5P08648 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ITGA5P08648 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ITGA5P08648 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ITGA5P08648 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ITGA5P08648 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ITGA5P08648 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ITGA5P08648 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ITGA5P08648 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ITGA5P08648 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ITGA5P08648 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ITGA5P08648 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ITGA5P08648 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ITGA5P08648 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ITGA5P08648 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ITGA5P08648 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ITGA5P08648 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ITGA5P08648 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ITGA5P08648 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ITGA5P08648 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ITGA5P08648 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ITGA5P08648 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ITGA5P08648 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ITGA5P08648 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ITGA5P08648 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ITGA5P08648 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ITGA5P08648 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ITGA5P08648 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ITGA5P08648 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ITGA5P08648 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ITGA5P08648 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ITGA5P08648 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ITGA5P08648 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ITGA5P08648 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ITGA5P08648 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ITGA5P08648 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ITGA5P08648 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ITGA5P08648 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ITGA5P08648 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ITGA5P08648 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ITGA5P08648 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ITGA5P08648 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ITGA5P08648 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ITGA5P08648 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ITGA5P08648 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ITGA5P08648 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ITGA5P08648 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms