Protein–RNA interactions for Protein: O43583

DENR, Density-regulated protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENRO43583 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DENRO43583 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DENRO43583 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
DENRO43583 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DENRO43583 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DENRO43583 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DENRO43583 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DENRO43583 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DENRO43583 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DENRO43583 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DENRO43583 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DENRO43583 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DENRO43583 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DENRO43583 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DENRO43583 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
DENRO43583 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
DENRO43583 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
DENRO43583 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
DENRO43583 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
DENRO43583 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
DENRO43583 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
DENRO43583 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
DENRO43583 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
DENRO43583 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
DENRO43583 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
DENRO43583 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
DENRO43583 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
DENRO43583 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
DENRO43583 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
DENRO43583 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
DENRO43583 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
DENRO43583 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
DENRO43583 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
DENRO43583 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
DENRO43583 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
DENRO43583 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
DENRO43583 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
DENRO43583 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
DENRO43583 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
DENRO43583 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
DENRO43583 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
DENRO43583 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
DENRO43583 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
DENRO43583 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
DENRO43583 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
DENRO43583 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
DENRO43583 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
DENRO43583 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
DENRO43583 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
DENRO43583 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
DENRO43583 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
DENRO43583 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
DENRO43583 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DENRO43583 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DENRO43583 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DENRO43583 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DENRO43583 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DENRO43583 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DENRO43583 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DENRO43583 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
DENRO43583 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DENRO43583 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DENRO43583 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DENRO43583 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DENRO43583 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DENRO43583 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
DENRO43583 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DENRO43583 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DENRO43583 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DENRO43583 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DENRO43583 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DENRO43583 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DENRO43583 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DENRO43583 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DENRO43583 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DENRO43583 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DENRO43583 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DENRO43583 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DENRO43583 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DENRO43583 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DENRO43583 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DENRO43583 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DENRO43583 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DENRO43583 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
DENRO43583 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DENRO43583 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DENRO43583 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DENRO43583 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DENRO43583 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DENRO43583 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DENRO43583 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DENRO43583 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
DENRO43583 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DENRO43583 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DENRO43583 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DENRO43583 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DENRO43583 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DENRO43583 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DENRO43583 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DENRO43583 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms