Protein–RNA interactions for Protein: O43365

HOXA3, Homeobox protein Hox-A3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3O43365 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HOXA3O43365 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HOXA3O43365 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HOXA3O43365 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HOXA3O43365 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HOXA3O43365 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HOXA3O43365 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HOXA3O43365 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
HOXA3O43365 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HOXA3O43365 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HOXA3O43365 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HOXA3O43365 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HOXA3O43365 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HOXA3O43365 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
HOXA3O43365 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HOXA3O43365 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HOXA3O43365 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HOXA3O43365 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HOXA3O43365 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HOXA3O43365 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HOXA3O43365 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HOXA3O43365 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HOXA3O43365 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HOXA3O43365 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HOXA3O43365 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HOXA3O43365 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HOXA3O43365 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HOXA3O43365 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HOXA3O43365 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HOXA3O43365 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
HOXA3O43365 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HOXA3O43365 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HOXA3O43365 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
HOXA3O43365 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
HOXA3O43365 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
HOXA3O43365 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
HOXA3O43365 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
HOXA3O43365 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
HOXA3O43365 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HOXA3O43365 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HOXA3O43365 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HOXA3O43365 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HOXA3O43365 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HOXA3O43365 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
HOXA3O43365 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HOXA3O43365 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HOXA3O43365 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
HOXA3O43365 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
HOXA3O43365 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HOXA3O43365 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HOXA3O43365 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
HOXA3O43365 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HOXA3O43365 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HOXA3O43365 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
HOXA3O43365 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HOXA3O43365 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
HOXA3O43365 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HOXA3O43365 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
HOXA3O43365 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HOXA3O43365 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HOXA3O43365 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HOXA3O43365 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HOXA3O43365 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HOXA3O43365 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HOXA3O43365 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HOXA3O43365 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HOXA3O43365 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HOXA3O43365 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HOXA3O43365 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HOXA3O43365 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HOXA3O43365 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HOXA3O43365 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HOXA3O43365 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HOXA3O43365 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HOXA3O43365 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HOXA3O43365 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HOXA3O43365 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HOXA3O43365 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HOXA3O43365 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HOXA3O43365 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HOXA3O43365 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HOXA3O43365 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
HOXA3O43365 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
HOXA3O43365 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HOXA3O43365 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
HOXA3O43365 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HOXA3O43365 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HOXA3O43365 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
HOXA3O43365 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HOXA3O43365 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
HOXA3O43365 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HOXA3O43365 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HOXA3O43365 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HOXA3O43365 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HOXA3O43365 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HOXA3O43365 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HOXA3O43365 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HOXA3O43365 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HOXA3O43365 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HOXA3O43365 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
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