Protein–RNA interactions for Protein: O15143

ARPC1B, Actin-related protein 2/3 complex subunit 1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARPC1BO15143 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ARPC1BO15143 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ARPC1BO15143 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ARPC1BO15143 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ARPC1BO15143 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ARPC1BO15143 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ARPC1BO15143 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ARPC1BO15143 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ARPC1BO15143 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ARPC1BO15143 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ARPC1BO15143 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ARPC1BO15143 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ARPC1BO15143 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ARPC1BO15143 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ARPC1BO15143 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ARPC1BO15143 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ARPC1BO15143 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ARPC1BO15143 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ARPC1BO15143 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ARPC1BO15143 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ARPC1BO15143 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ARPC1BO15143 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ARPC1BO15143 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ARPC1BO15143 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ARPC1BO15143 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ARPC1BO15143 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ARPC1BO15143 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ARPC1BO15143 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ARPC1BO15143 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ARPC1BO15143 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ARPC1BO15143 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ARPC1BO15143 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ARPC1BO15143 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ARPC1BO15143 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ARPC1BO15143 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ARPC1BO15143 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ARPC1BO15143 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ARPC1BO15143 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARPC1BO15143 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARPC1BO15143 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ARPC1BO15143 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARPC1BO15143 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARPC1BO15143 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARPC1BO15143 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARPC1BO15143 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARPC1BO15143 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARPC1BO15143 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARPC1BO15143 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARPC1BO15143 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARPC1BO15143 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARPC1BO15143 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARPC1BO15143 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARPC1BO15143 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARPC1BO15143 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARPC1BO15143 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARPC1BO15143 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARPC1BO15143 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARPC1BO15143 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARPC1BO15143 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARPC1BO15143 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARPC1BO15143 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARPC1BO15143 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARPC1BO15143 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARPC1BO15143 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARPC1BO15143 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARPC1BO15143 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARPC1BO15143 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARPC1BO15143 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARPC1BO15143 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARPC1BO15143 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARPC1BO15143 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARPC1BO15143 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARPC1BO15143 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARPC1BO15143 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARPC1BO15143 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARPC1BO15143 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARPC1BO15143 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARPC1BO15143 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARPC1BO15143 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARPC1BO15143 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARPC1BO15143 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARPC1BO15143 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARPC1BO15143 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARPC1BO15143 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARPC1BO15143 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARPC1BO15143 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARPC1BO15143 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARPC1BO15143 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARPC1BO15143 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARPC1BO15143 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARPC1BO15143 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARPC1BO15143 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARPC1BO15143 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARPC1BO15143 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARPC1BO15143 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARPC1BO15143 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARPC1BO15143 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARPC1BO15143 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARPC1BO15143 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARPC1BO15143 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms