Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PTPRTO14522 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PTPRTO14522 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PTPRTO14522 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PTPRTO14522 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PTPRTO14522 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PTPRTO14522 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PTPRTO14522 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PTPRTO14522 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
PTPRTO14522 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PTPRTO14522 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
PTPRTO14522 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PTPRTO14522 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
PTPRTO14522 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PTPRTO14522 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PTPRTO14522 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PTPRTO14522 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PTPRTO14522 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PTPRTO14522 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PTPRTO14522 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PTPRTO14522 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PTPRTO14522 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PTPRTO14522 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PTPRTO14522 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
PTPRTO14522 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PTPRTO14522 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PTPRTO14522 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PTPRTO14522 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PTPRTO14522 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PTPRTO14522 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PTPRTO14522 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PTPRTO14522 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PTPRTO14522 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PTPRTO14522 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PTPRTO14522 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PTPRTO14522 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PTPRTO14522 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PTPRTO14522 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PTPRTO14522 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PTPRTO14522 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PTPRTO14522 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PTPRTO14522 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
PTPRTO14522 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PTPRTO14522 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PTPRTO14522 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
PTPRTO14522 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PTPRTO14522 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PTPRTO14522 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PTPRTO14522 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
PTPRTO14522 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PTPRTO14522 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PTPRTO14522 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PTPRTO14522 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PTPRTO14522 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PTPRTO14522 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PTPRTO14522 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
PTPRTO14522 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PTPRTO14522 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PTPRTO14522 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PTPRTO14522 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PTPRTO14522 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PTPRTO14522 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
PTPRTO14522 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PTPRTO14522 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PTPRTO14522 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PTPRTO14522 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PTPRTO14522 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PTPRTO14522 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PTPRTO14522 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PTPRTO14522 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PTPRTO14522 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
PTPRTO14522 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PTPRTO14522 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PTPRTO14522 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PTPRTO14522 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PTPRTO14522 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PTPRTO14522 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PTPRTO14522 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PTPRTO14522 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PTPRTO14522 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PTPRTO14522 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PTPRTO14522 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PTPRTO14522 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PTPRTO14522 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PTPRTO14522 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
PTPRTO14522 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PTPRTO14522 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PTPRTO14522 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PTPRTO14522 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PTPRTO14522 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PTPRTO14522 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PTPRTO14522 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PTPRTO14522 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PTPRTO14522 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PTPRTO14522 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PTPRTO14522 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PTPRTO14522 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
PTPRTO14522 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PTPRTO14522 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PTPRTO14522 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
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