Protein–RNA interactions for Protein: A7XYQ1

SOBP, Sine oculis-binding protein homolog, humanhuman

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Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBPA7XYQ1 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SOBPA7XYQ1 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SOBPA7XYQ1 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SOBPA7XYQ1 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SOBPA7XYQ1 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SOBPA7XYQ1 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SOBPA7XYQ1 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SOBPA7XYQ1 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
SOBPA7XYQ1 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SOBPA7XYQ1 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SOBPA7XYQ1 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SOBPA7XYQ1 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SOBPA7XYQ1 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
SOBPA7XYQ1 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SOBPA7XYQ1 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SOBPA7XYQ1 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SOBPA7XYQ1 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
SOBPA7XYQ1 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SOBPA7XYQ1 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SOBPA7XYQ1 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SOBPA7XYQ1 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SOBPA7XYQ1 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SOBPA7XYQ1 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SOBPA7XYQ1 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SOBPA7XYQ1 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SOBPA7XYQ1 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SOBPA7XYQ1 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SOBPA7XYQ1 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SOBPA7XYQ1 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SOBPA7XYQ1 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SOBPA7XYQ1 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SOBPA7XYQ1 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SOBPA7XYQ1 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SOBPA7XYQ1 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SOBPA7XYQ1 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SOBPA7XYQ1 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SOBPA7XYQ1 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SOBPA7XYQ1 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SOBPA7XYQ1 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SOBPA7XYQ1 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SOBPA7XYQ1 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SOBPA7XYQ1 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SOBPA7XYQ1 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SOBPA7XYQ1 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SOBPA7XYQ1 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SOBPA7XYQ1 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SOBPA7XYQ1 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SOBPA7XYQ1 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SOBPA7XYQ1 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SOBPA7XYQ1 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SOBPA7XYQ1 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SOBPA7XYQ1 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SOBPA7XYQ1 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SOBPA7XYQ1 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SOBPA7XYQ1 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SOBPA7XYQ1 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SOBPA7XYQ1 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SOBPA7XYQ1 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SOBPA7XYQ1 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SOBPA7XYQ1 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SOBPA7XYQ1 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SOBPA7XYQ1 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SOBPA7XYQ1 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SOBPA7XYQ1 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SOBPA7XYQ1 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SOBPA7XYQ1 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SOBPA7XYQ1 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SOBPA7XYQ1 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SOBPA7XYQ1 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SOBPA7XYQ1 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SOBPA7XYQ1 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SOBPA7XYQ1 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SOBPA7XYQ1 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SOBPA7XYQ1 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SOBPA7XYQ1 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SOBPA7XYQ1 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SOBPA7XYQ1 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SOBPA7XYQ1 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SOBPA7XYQ1 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SOBPA7XYQ1 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SOBPA7XYQ1 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SOBPA7XYQ1 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SOBPA7XYQ1 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SOBPA7XYQ1 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SOBPA7XYQ1 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SOBPA7XYQ1 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SOBPA7XYQ1 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SOBPA7XYQ1 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SOBPA7XYQ1 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SOBPA7XYQ1 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SOBPA7XYQ1 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SOBPA7XYQ1 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SOBPA7XYQ1 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SOBPA7XYQ1 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SOBPA7XYQ1 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SOBPA7XYQ1 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SOBPA7XYQ1 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SOBPA7XYQ1 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SOBPA7XYQ1 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SOBPA7XYQ1 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
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