Protein–RNA interactions for Protein: A6NKT7

RGPD3, RanBP2-like and GRIP domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD3A6NKT7 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
RGPD3A6NKT7 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RGPD3A6NKT7 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RGPD3A6NKT7 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RGPD3A6NKT7 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RGPD3A6NKT7 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
RGPD3A6NKT7 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
RGPD3A6NKT7 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
RGPD3A6NKT7 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RGPD3A6NKT7 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RGPD3A6NKT7 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RGPD3A6NKT7 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RGPD3A6NKT7 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RGPD3A6NKT7 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
RGPD3A6NKT7 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RGPD3A6NKT7 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RGPD3A6NKT7 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RGPD3A6NKT7 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RGPD3A6NKT7 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RGPD3A6NKT7 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RGPD3A6NKT7 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RGPD3A6NKT7 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RGPD3A6NKT7 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RGPD3A6NKT7 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RGPD3A6NKT7 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
RGPD3A6NKT7 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
RGPD3A6NKT7 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RGPD3A6NKT7 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RGPD3A6NKT7 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RGPD3A6NKT7 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RGPD3A6NKT7 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RGPD3A6NKT7 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RGPD3A6NKT7 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RGPD3A6NKT7 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RGPD3A6NKT7 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RGPD3A6NKT7 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RGPD3A6NKT7 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
RGPD3A6NKT7 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RGPD3A6NKT7 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RGPD3A6NKT7 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RGPD3A6NKT7 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RGPD3A6NKT7 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RGPD3A6NKT7 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
RGPD3A6NKT7 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.24
RGPD3A6NKT7 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.24
RGPD3A6NKT7 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
RGPD3A6NKT7 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
RGPD3A6NKT7 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RGPD3A6NKT7 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
RGPD3A6NKT7 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
RGPD3A6NKT7 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.24
RGPD3A6NKT7 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
RGPD3A6NKT7 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
RGPD3A6NKT7 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RGPD3A6NKT7 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RGPD3A6NKT7 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RGPD3A6NKT7 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RGPD3A6NKT7 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RGPD3A6NKT7 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RGPD3A6NKT7 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RGPD3A6NKT7 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RGPD3A6NKT7 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RGPD3A6NKT7 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RGPD3A6NKT7 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RGPD3A6NKT7 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RGPD3A6NKT7 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RGPD3A6NKT7 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RGPD3A6NKT7 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RGPD3A6NKT7 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RGPD3A6NKT7 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RGPD3A6NKT7 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RGPD3A6NKT7 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RGPD3A6NKT7 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RGPD3A6NKT7 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RGPD3A6NKT7 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RGPD3A6NKT7 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RGPD3A6NKT7 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RGPD3A6NKT7 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RGPD3A6NKT7 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RGPD3A6NKT7 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RGPD3A6NKT7 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RGPD3A6NKT7 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RGPD3A6NKT7 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RGPD3A6NKT7 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RGPD3A6NKT7 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RGPD3A6NKT7 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RGPD3A6NKT7 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RGPD3A6NKT7 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RGPD3A6NKT7 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RGPD3A6NKT7 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RGPD3A6NKT7 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RGPD3A6NKT7 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RGPD3A6NKT7 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RGPD3A6NKT7 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RGPD3A6NKT7 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RGPD3A6NKT7 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RGPD3A6NKT7 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RGPD3A6NKT7 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RGPD3A6NKT7 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RGPD3A6NKT7 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms