Protein–RNA interactions for Protein: V9GYD0

ARL2-SNX15, ARL2-SNX15 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL2-SNX15V9GYD0 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
ARL2-SNX15V9GYD0 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
ARL2-SNX15V9GYD0 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC14.18□□□□□ -0.14
ARL2-SNX15V9GYD0 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
ARL2-SNX15V9GYD0 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
ARL2-SNX15V9GYD0 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
ARL2-SNX15V9GYD0 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
ARL2-SNX15V9GYD0 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
ARL2-SNX15V9GYD0 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
ARL2-SNX15V9GYD0 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
ARL2-SNX15V9GYD0 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
ARL2-SNX15V9GYD0 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
ARL2-SNX15V9GYD0 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
ARL2-SNX15V9GYD0 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
ARL2-SNX15V9GYD0 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
ARL2-SNX15V9GYD0 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
ARL2-SNX15V9GYD0 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
ARL2-SNX15V9GYD0 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
ARL2-SNX15V9GYD0 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
ARL2-SNX15V9GYD0 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
ARL2-SNX15V9GYD0 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
ARL2-SNX15V9GYD0 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
ARL2-SNX15V9GYD0 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
ARL2-SNX15V9GYD0 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
ARL2-SNX15V9GYD0 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
ARL2-SNX15V9GYD0 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
ARL2-SNX15V9GYD0 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC14.17□□□□□ -0.14
ARL2-SNX15V9GYD0 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
ARL2-SNX15V9GYD0 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
ARL2-SNX15V9GYD0 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
ARL2-SNX15V9GYD0 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
ARL2-SNX15V9GYD0 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
ARL2-SNX15V9GYD0 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
ARL2-SNX15V9GYD0 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
ARL2-SNX15V9GYD0 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
ARL2-SNX15V9GYD0 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
ARL2-SNX15V9GYD0 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
ARL2-SNX15V9GYD0 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
ARL2-SNX15V9GYD0 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
ARL2-SNX15V9GYD0 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC14.17□□□□□ -0.14
ARL2-SNX15V9GYD0 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
ARL2-SNX15V9GYD0 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.17□□□□□ -0.14
ARL2-SNX15V9GYD0 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
ARL2-SNX15V9GYD0 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
ARL2-SNX15V9GYD0 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
ARL2-SNX15V9GYD0 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
ARL2-SNX15V9GYD0 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
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ARL2-SNX15V9GYD0 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
ARL2-SNX15V9GYD0 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
ARL2-SNX15V9GYD0 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
ARL2-SNX15V9GYD0 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
ARL2-SNX15V9GYD0 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
ARL2-SNX15V9GYD0 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
ARL2-SNX15V9GYD0 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
ARL2-SNX15V9GYD0 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
ARL2-SNX15V9GYD0 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
ARL2-SNX15V9GYD0 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
ARL2-SNX15V9GYD0 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
ARL2-SNX15V9GYD0 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
ARL2-SNX15V9GYD0 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
ARL2-SNX15V9GYD0 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
ARL2-SNX15V9GYD0 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
ARL2-SNX15V9GYD0 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
ARL2-SNX15V9GYD0 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
ARL2-SNX15V9GYD0 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
ARL2-SNX15V9GYD0 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
ARL2-SNX15V9GYD0 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
ARL2-SNX15V9GYD0 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
ARL2-SNX15V9GYD0 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
ARL2-SNX15V9GYD0 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
ARL2-SNX15V9GYD0 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
ARL2-SNX15V9GYD0 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
ARL2-SNX15V9GYD0 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
ARL2-SNX15V9GYD0 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
ARL2-SNX15V9GYD0 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
ARL2-SNX15V9GYD0 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
ARL2-SNX15V9GYD0 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC14.16□□□□□ -0.14
ARL2-SNX15V9GYD0 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
ARL2-SNX15V9GYD0 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
ARL2-SNX15V9GYD0 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
ARL2-SNX15V9GYD0 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
ARL2-SNX15V9GYD0 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
ARL2-SNX15V9GYD0 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
ARL2-SNX15V9GYD0 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
ARL2-SNX15V9GYD0 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
ARL2-SNX15V9GYD0 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
ARL2-SNX15V9GYD0 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
ARL2-SNX15V9GYD0 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
ARL2-SNX15V9GYD0 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC14.16□□□□□ -0.14
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
ARL2-SNX15V9GYD0 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
ARL2-SNX15V9GYD0 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
ARL2-SNX15V9GYD0 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
ARL2-SNX15V9GYD0 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
ARL2-SNX15V9GYD0 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
ARL2-SNX15V9GYD0 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
ARL2-SNX15V9GYD0 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
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