Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNE0

EDAR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member EDAR, humanhuman

Predictions only

Length 448 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDARQ9UNE0 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
EDARQ9UNE0 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
EDARQ9UNE0 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
EDARQ9UNE0 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
EDARQ9UNE0 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
EDARQ9UNE0 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
EDARQ9UNE0 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
EDARQ9UNE0 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
EDARQ9UNE0 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
EDARQ9UNE0 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
EDARQ9UNE0 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
EDARQ9UNE0 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
EDARQ9UNE0 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
EDARQ9UNE0 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
EDARQ9UNE0 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
EDARQ9UNE0 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
EDARQ9UNE0 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
EDARQ9UNE0 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
EDARQ9UNE0 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
EDARQ9UNE0 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
EDARQ9UNE0 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EDARQ9UNE0 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EDARQ9UNE0 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EDARQ9UNE0 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EDARQ9UNE0 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EDARQ9UNE0 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EDARQ9UNE0 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EDARQ9UNE0 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EDARQ9UNE0 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EDARQ9UNE0 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EDARQ9UNE0 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
EDARQ9UNE0 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EDARQ9UNE0 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EDARQ9UNE0 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EDARQ9UNE0 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
EDARQ9UNE0 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EDARQ9UNE0 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EDARQ9UNE0 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
EDARQ9UNE0 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
EDARQ9UNE0 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EDARQ9UNE0 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EDARQ9UNE0 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EDARQ9UNE0 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EDARQ9UNE0 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EDARQ9UNE0 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EDARQ9UNE0 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
EDARQ9UNE0 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
EDARQ9UNE0 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EDARQ9UNE0 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EDARQ9UNE0 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EDARQ9UNE0 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EDARQ9UNE0 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EDARQ9UNE0 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EDARQ9UNE0 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EDARQ9UNE0 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EDARQ9UNE0 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EDARQ9UNE0 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
EDARQ9UNE0 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EDARQ9UNE0 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EDARQ9UNE0 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EDARQ9UNE0 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EDARQ9UNE0 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EDARQ9UNE0 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EDARQ9UNE0 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EDARQ9UNE0 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EDARQ9UNE0 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EDARQ9UNE0 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EDARQ9UNE0 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EDARQ9UNE0 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EDARQ9UNE0 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EDARQ9UNE0 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EDARQ9UNE0 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EDARQ9UNE0 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EDARQ9UNE0 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EDARQ9UNE0 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EDARQ9UNE0 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
EDARQ9UNE0 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
EDARQ9UNE0 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EDARQ9UNE0 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EDARQ9UNE0 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EDARQ9UNE0 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EDARQ9UNE0 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EDARQ9UNE0 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EDARQ9UNE0 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EDARQ9UNE0 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EDARQ9UNE0 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EDARQ9UNE0 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EDARQ9UNE0 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EDARQ9UNE0 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EDARQ9UNE0 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EDARQ9UNE0 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EDARQ9UNE0 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EDARQ9UNE0 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EDARQ9UNE0 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EDARQ9UNE0 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EDARQ9UNE0 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EDARQ9UNE0 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EDARQ9UNE0 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EDARQ9UNE0 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EDARQ9UNE0 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms