Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULP0

NDRG4, Protein NDRG4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDRG4Q9ULP0 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NDRG4Q9ULP0 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NDRG4Q9ULP0 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NDRG4Q9ULP0 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NDRG4Q9ULP0 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NDRG4Q9ULP0 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NDRG4Q9ULP0 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NDRG4Q9ULP0 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NDRG4Q9ULP0 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NDRG4Q9ULP0 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NDRG4Q9ULP0 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
NDRG4Q9ULP0 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NDRG4Q9ULP0 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NDRG4Q9ULP0 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NDRG4Q9ULP0 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NDRG4Q9ULP0 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NDRG4Q9ULP0 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NDRG4Q9ULP0 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NDRG4Q9ULP0 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NDRG4Q9ULP0 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NDRG4Q9ULP0 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NDRG4Q9ULP0 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NDRG4Q9ULP0 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NDRG4Q9ULP0 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NDRG4Q9ULP0 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NDRG4Q9ULP0 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NDRG4Q9ULP0 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NDRG4Q9ULP0 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
NDRG4Q9ULP0 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NDRG4Q9ULP0 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NDRG4Q9ULP0 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NDRG4Q9ULP0 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NDRG4Q9ULP0 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NDRG4Q9ULP0 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NDRG4Q9ULP0 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NDRG4Q9ULP0 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NDRG4Q9ULP0 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NDRG4Q9ULP0 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NDRG4Q9ULP0 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NDRG4Q9ULP0 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NDRG4Q9ULP0 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
NDRG4Q9ULP0 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
NDRG4Q9ULP0 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NDRG4Q9ULP0 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NDRG4Q9ULP0 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NDRG4Q9ULP0 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NDRG4Q9ULP0 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NDRG4Q9ULP0 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NDRG4Q9ULP0 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NDRG4Q9ULP0 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NDRG4Q9ULP0 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NDRG4Q9ULP0 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NDRG4Q9ULP0 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NDRG4Q9ULP0 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NDRG4Q9ULP0 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NDRG4Q9ULP0 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NDRG4Q9ULP0 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NDRG4Q9ULP0 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NDRG4Q9ULP0 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NDRG4Q9ULP0 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NDRG4Q9ULP0 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
NDRG4Q9ULP0 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NDRG4Q9ULP0 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NDRG4Q9ULP0 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NDRG4Q9ULP0 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NDRG4Q9ULP0 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NDRG4Q9ULP0 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NDRG4Q9ULP0 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NDRG4Q9ULP0 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NDRG4Q9ULP0 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NDRG4Q9ULP0 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NDRG4Q9ULP0 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NDRG4Q9ULP0 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NDRG4Q9ULP0 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NDRG4Q9ULP0 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NDRG4Q9ULP0 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NDRG4Q9ULP0 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NDRG4Q9ULP0 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NDRG4Q9ULP0 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NDRG4Q9ULP0 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NDRG4Q9ULP0 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NDRG4Q9ULP0 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NDRG4Q9ULP0 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NDRG4Q9ULP0 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NDRG4Q9ULP0 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NDRG4Q9ULP0 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NDRG4Q9ULP0 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
NDRG4Q9ULP0 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
NDRG4Q9ULP0 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NDRG4Q9ULP0 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
NDRG4Q9ULP0 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NDRG4Q9ULP0 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
NDRG4Q9ULP0 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NDRG4Q9ULP0 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NDRG4Q9ULP0 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
NDRG4Q9ULP0 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NDRG4Q9ULP0 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NDRG4Q9ULP0 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NDRG4Q9ULP0 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NDRG4Q9ULP0 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.1 ms