Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKS6

PACSIN3, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3Q9UKS6 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PACSIN3Q9UKS6 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PACSIN3Q9UKS6 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PACSIN3Q9UKS6 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PACSIN3Q9UKS6 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PACSIN3Q9UKS6 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PACSIN3Q9UKS6 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PACSIN3Q9UKS6 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PACSIN3Q9UKS6 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PACSIN3Q9UKS6 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PACSIN3Q9UKS6 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PACSIN3Q9UKS6 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PACSIN3Q9UKS6 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PACSIN3Q9UKS6 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PACSIN3Q9UKS6 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PACSIN3Q9UKS6 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PACSIN3Q9UKS6 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PACSIN3Q9UKS6 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PACSIN3Q9UKS6 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PACSIN3Q9UKS6 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PACSIN3Q9UKS6 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
PACSIN3Q9UKS6 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
PACSIN3Q9UKS6 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
PACSIN3Q9UKS6 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
PACSIN3Q9UKS6 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
PACSIN3Q9UKS6 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
PACSIN3Q9UKS6 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
PACSIN3Q9UKS6 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PACSIN3Q9UKS6 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PACSIN3Q9UKS6 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PACSIN3Q9UKS6 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PACSIN3Q9UKS6 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PACSIN3Q9UKS6 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PACSIN3Q9UKS6 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PACSIN3Q9UKS6 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PACSIN3Q9UKS6 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PACSIN3Q9UKS6 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PACSIN3Q9UKS6 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PACSIN3Q9UKS6 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PACSIN3Q9UKS6 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PACSIN3Q9UKS6 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PACSIN3Q9UKS6 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PACSIN3Q9UKS6 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PACSIN3Q9UKS6 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PACSIN3Q9UKS6 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PACSIN3Q9UKS6 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PACSIN3Q9UKS6 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PACSIN3Q9UKS6 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PACSIN3Q9UKS6 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PACSIN3Q9UKS6 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PACSIN3Q9UKS6 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PACSIN3Q9UKS6 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PACSIN3Q9UKS6 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PACSIN3Q9UKS6 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PACSIN3Q9UKS6 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PACSIN3Q9UKS6 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PACSIN3Q9UKS6 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PACSIN3Q9UKS6 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PACSIN3Q9UKS6 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PACSIN3Q9UKS6 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PACSIN3Q9UKS6 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PACSIN3Q9UKS6 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
PACSIN3Q9UKS6 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PACSIN3Q9UKS6 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PACSIN3Q9UKS6 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PACSIN3Q9UKS6 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PACSIN3Q9UKS6 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PACSIN3Q9UKS6 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PACSIN3Q9UKS6 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PACSIN3Q9UKS6 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PACSIN3Q9UKS6 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PACSIN3Q9UKS6 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PACSIN3Q9UKS6 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PACSIN3Q9UKS6 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PACSIN3Q9UKS6 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PACSIN3Q9UKS6 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PACSIN3Q9UKS6 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PACSIN3Q9UKS6 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PACSIN3Q9UKS6 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PACSIN3Q9UKS6 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PACSIN3Q9UKS6 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PACSIN3Q9UKS6 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PACSIN3Q9UKS6 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PACSIN3Q9UKS6 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PACSIN3Q9UKS6 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
PACSIN3Q9UKS6 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
PACSIN3Q9UKS6 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
PACSIN3Q9UKS6 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PACSIN3Q9UKS6 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PACSIN3Q9UKS6 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PACSIN3Q9UKS6 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PACSIN3Q9UKS6 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PACSIN3Q9UKS6 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PACSIN3Q9UKS6 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PACSIN3Q9UKS6 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PACSIN3Q9UKS6 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PACSIN3Q9UKS6 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PACSIN3Q9UKS6 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PACSIN3Q9UKS6 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PACSIN3Q9UKS6 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms