Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKD2

MRTO4, mRNA turnover protein 4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRTO4Q9UKD2 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
MRTO4Q9UKD2 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
MRTO4Q9UKD2 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
MRTO4Q9UKD2 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
MRTO4Q9UKD2 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
MRTO4Q9UKD2 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
MRTO4Q9UKD2 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
MRTO4Q9UKD2 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
MRTO4Q9UKD2 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
MRTO4Q9UKD2 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
MRTO4Q9UKD2 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
MRTO4Q9UKD2 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
MRTO4Q9UKD2 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
MRTO4Q9UKD2 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
MRTO4Q9UKD2 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
MRTO4Q9UKD2 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
MRTO4Q9UKD2 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
MRTO4Q9UKD2 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
MRTO4Q9UKD2 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
MRTO4Q9UKD2 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
MRTO4Q9UKD2 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
MRTO4Q9UKD2 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
MRTO4Q9UKD2 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
MRTO4Q9UKD2 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
MRTO4Q9UKD2 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
MRTO4Q9UKD2 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
MRTO4Q9UKD2 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
MRTO4Q9UKD2 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
MRTO4Q9UKD2 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
MRTO4Q9UKD2 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
MRTO4Q9UKD2 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
MRTO4Q9UKD2 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
MRTO4Q9UKD2 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
MRTO4Q9UKD2 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
MRTO4Q9UKD2 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
MRTO4Q9UKD2 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
MRTO4Q9UKD2 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
MRTO4Q9UKD2 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
MRTO4Q9UKD2 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
MRTO4Q9UKD2 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
MRTO4Q9UKD2 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
MRTO4Q9UKD2 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
MRTO4Q9UKD2 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
MRTO4Q9UKD2 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
MRTO4Q9UKD2 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
MRTO4Q9UKD2 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
MRTO4Q9UKD2 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
MRTO4Q9UKD2 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
MRTO4Q9UKD2 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
MRTO4Q9UKD2 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
MRTO4Q9UKD2 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
MRTO4Q9UKD2 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
MRTO4Q9UKD2 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
MRTO4Q9UKD2 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
MRTO4Q9UKD2 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
MRTO4Q9UKD2 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
MRTO4Q9UKD2 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
MRTO4Q9UKD2 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
MRTO4Q9UKD2 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
MRTO4Q9UKD2 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
MRTO4Q9UKD2 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
MRTO4Q9UKD2 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
MRTO4Q9UKD2 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
MRTO4Q9UKD2 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
MRTO4Q9UKD2 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
MRTO4Q9UKD2 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
MRTO4Q9UKD2 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
MRTO4Q9UKD2 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
MRTO4Q9UKD2 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
MRTO4Q9UKD2 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
MRTO4Q9UKD2 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
MRTO4Q9UKD2 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
MRTO4Q9UKD2 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
MRTO4Q9UKD2 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
MRTO4Q9UKD2 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
MRTO4Q9UKD2 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
MRTO4Q9UKD2 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
MRTO4Q9UKD2 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
MRTO4Q9UKD2 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
MRTO4Q9UKD2 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
MRTO4Q9UKD2 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
MRTO4Q9UKD2 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
MRTO4Q9UKD2 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
MRTO4Q9UKD2 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
MRTO4Q9UKD2 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
MRTO4Q9UKD2 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
MRTO4Q9UKD2 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
MRTO4Q9UKD2 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
MRTO4Q9UKD2 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
MRTO4Q9UKD2 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
MRTO4Q9UKD2 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
MRTO4Q9UKD2 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
MRTO4Q9UKD2 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
MRTO4Q9UKD2 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
MRTO4Q9UKD2 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
MRTO4Q9UKD2 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
MRTO4Q9UKD2 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
MRTO4Q9UKD2 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
MRTO4Q9UKD2 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
MRTO4Q9UKD2 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms