Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJU5

FOXD3, Forkhead box protein D3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD3Q9UJU5 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FOXD3Q9UJU5 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FOXD3Q9UJU5 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FOXD3Q9UJU5 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FOXD3Q9UJU5 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FOXD3Q9UJU5 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FOXD3Q9UJU5 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FOXD3Q9UJU5 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FOXD3Q9UJU5 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FOXD3Q9UJU5 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FOXD3Q9UJU5 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FOXD3Q9UJU5 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FOXD3Q9UJU5 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FOXD3Q9UJU5 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FOXD3Q9UJU5 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FOXD3Q9UJU5 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FOXD3Q9UJU5 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FOXD3Q9UJU5 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FOXD3Q9UJU5 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FOXD3Q9UJU5 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FOXD3Q9UJU5 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FOXD3Q9UJU5 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FOXD3Q9UJU5 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FOXD3Q9UJU5 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FOXD3Q9UJU5 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FOXD3Q9UJU5 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FOXD3Q9UJU5 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FOXD3Q9UJU5 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FOXD3Q9UJU5 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FOXD3Q9UJU5 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FOXD3Q9UJU5 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FOXD3Q9UJU5 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
FOXD3Q9UJU5 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FOXD3Q9UJU5 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FOXD3Q9UJU5 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FOXD3Q9UJU5 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
FOXD3Q9UJU5 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FOXD3Q9UJU5 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FOXD3Q9UJU5 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FOXD3Q9UJU5 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FOXD3Q9UJU5 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FOXD3Q9UJU5 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FOXD3Q9UJU5 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FOXD3Q9UJU5 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FOXD3Q9UJU5 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FOXD3Q9UJU5 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FOXD3Q9UJU5 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FOXD3Q9UJU5 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
FOXD3Q9UJU5 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
FOXD3Q9UJU5 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FOXD3Q9UJU5 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FOXD3Q9UJU5 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FOXD3Q9UJU5 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FOXD3Q9UJU5 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FOXD3Q9UJU5 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FOXD3Q9UJU5 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FOXD3Q9UJU5 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FOXD3Q9UJU5 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FOXD3Q9UJU5 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
FOXD3Q9UJU5 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FOXD3Q9UJU5 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FOXD3Q9UJU5 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FOXD3Q9UJU5 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FOXD3Q9UJU5 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FOXD3Q9UJU5 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FOXD3Q9UJU5 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FOXD3Q9UJU5 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FOXD3Q9UJU5 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FOXD3Q9UJU5 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FOXD3Q9UJU5 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FOXD3Q9UJU5 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FOXD3Q9UJU5 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
FOXD3Q9UJU5 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FOXD3Q9UJU5 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FOXD3Q9UJU5 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FOXD3Q9UJU5 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FOXD3Q9UJU5 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FOXD3Q9UJU5 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FOXD3Q9UJU5 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FOXD3Q9UJU5 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FOXD3Q9UJU5 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FOXD3Q9UJU5 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
FOXD3Q9UJU5 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FOXD3Q9UJU5 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FOXD3Q9UJU5 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FOXD3Q9UJU5 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FOXD3Q9UJU5 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
FOXD3Q9UJU5 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
FOXD3Q9UJU5 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FOXD3Q9UJU5 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FOXD3Q9UJU5 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FOXD3Q9UJU5 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FOXD3Q9UJU5 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FOXD3Q9UJU5 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FOXD3Q9UJU5 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FOXD3Q9UJU5 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FOXD3Q9UJU5 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
FOXD3Q9UJU5 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
FOXD3Q9UJU5 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
FOXD3Q9UJU5 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms