Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHG0

DCDC2, Doublecortin domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 476 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCDC2Q9UHG0 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
DCDC2Q9UHG0 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
DCDC2Q9UHG0 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
DCDC2Q9UHG0 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
DCDC2Q9UHG0 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
DCDC2Q9UHG0 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
DCDC2Q9UHG0 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
DCDC2Q9UHG0 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
DCDC2Q9UHG0 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
DCDC2Q9UHG0 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
DCDC2Q9UHG0 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
DCDC2Q9UHG0 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
DCDC2Q9UHG0 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
DCDC2Q9UHG0 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
DCDC2Q9UHG0 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
DCDC2Q9UHG0 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
DCDC2Q9UHG0 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
DCDC2Q9UHG0 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
DCDC2Q9UHG0 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
DCDC2Q9UHG0 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
DCDC2Q9UHG0 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
DCDC2Q9UHG0 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
DCDC2Q9UHG0 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
DCDC2Q9UHG0 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DCDC2Q9UHG0 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DCDC2Q9UHG0 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DCDC2Q9UHG0 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DCDC2Q9UHG0 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DCDC2Q9UHG0 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
DCDC2Q9UHG0 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DCDC2Q9UHG0 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DCDC2Q9UHG0 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DCDC2Q9UHG0 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DCDC2Q9UHG0 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DCDC2Q9UHG0 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DCDC2Q9UHG0 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DCDC2Q9UHG0 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DCDC2Q9UHG0 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DCDC2Q9UHG0 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DCDC2Q9UHG0 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DCDC2Q9UHG0 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
DCDC2Q9UHG0 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DCDC2Q9UHG0 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DCDC2Q9UHG0 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DCDC2Q9UHG0 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DCDC2Q9UHG0 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DCDC2Q9UHG0 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DCDC2Q9UHG0 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DCDC2Q9UHG0 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DCDC2Q9UHG0 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DCDC2Q9UHG0 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DCDC2Q9UHG0 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DCDC2Q9UHG0 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DCDC2Q9UHG0 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DCDC2Q9UHG0 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DCDC2Q9UHG0 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DCDC2Q9UHG0 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
DCDC2Q9UHG0 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DCDC2Q9UHG0 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DCDC2Q9UHG0 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DCDC2Q9UHG0 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
DCDC2Q9UHG0 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DCDC2Q9UHG0 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DCDC2Q9UHG0 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DCDC2Q9UHG0 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
DCDC2Q9UHG0 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DCDC2Q9UHG0 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DCDC2Q9UHG0 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DCDC2Q9UHG0 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DCDC2Q9UHG0 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DCDC2Q9UHG0 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DCDC2Q9UHG0 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DCDC2Q9UHG0 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DCDC2Q9UHG0 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DCDC2Q9UHG0 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DCDC2Q9UHG0 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DCDC2Q9UHG0 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DCDC2Q9UHG0 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DCDC2Q9UHG0 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DCDC2Q9UHG0 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DCDC2Q9UHG0 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DCDC2Q9UHG0 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
DCDC2Q9UHG0 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DCDC2Q9UHG0 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DCDC2Q9UHG0 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DCDC2Q9UHG0 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DCDC2Q9UHG0 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DCDC2Q9UHG0 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DCDC2Q9UHG0 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
DCDC2Q9UHG0 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DCDC2Q9UHG0 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DCDC2Q9UHG0 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DCDC2Q9UHG0 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
DCDC2Q9UHG0 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DCDC2Q9UHG0 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DCDC2Q9UHG0 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
DCDC2Q9UHG0 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DCDC2Q9UHG0 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DCDC2Q9UHG0 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DCDC2Q9UHG0 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms