Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU2

DKK2, Dickkopf-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK2Q9UBU2 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
DKK2Q9UBU2 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
DKK2Q9UBU2 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
DKK2Q9UBU2 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
DKK2Q9UBU2 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
DKK2Q9UBU2 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
DKK2Q9UBU2 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
DKK2Q9UBU2 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
DKK2Q9UBU2 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
DKK2Q9UBU2 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
DKK2Q9UBU2 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
DKK2Q9UBU2 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
DKK2Q9UBU2 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
DKK2Q9UBU2 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
DKK2Q9UBU2 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
DKK2Q9UBU2 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
DKK2Q9UBU2 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
DKK2Q9UBU2 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
DKK2Q9UBU2 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
DKK2Q9UBU2 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
DKK2Q9UBU2 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
DKK2Q9UBU2 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
DKK2Q9UBU2 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
DKK2Q9UBU2 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
DKK2Q9UBU2 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC13.6□□□□□ -0.23
DKK2Q9UBU2 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
DKK2Q9UBU2 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
DKK2Q9UBU2 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
DKK2Q9UBU2 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
DKK2Q9UBU2 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
DKK2Q9UBU2 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
DKK2Q9UBU2 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
DKK2Q9UBU2 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
DKK2Q9UBU2 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
DKK2Q9UBU2 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
DKK2Q9UBU2 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
DKK2Q9UBU2 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
DKK2Q9UBU2 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
DKK2Q9UBU2 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
DKK2Q9UBU2 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
DKK2Q9UBU2 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
DKK2Q9UBU2 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
DKK2Q9UBU2 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
DKK2Q9UBU2 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
DKK2Q9UBU2 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
DKK2Q9UBU2 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
DKK2Q9UBU2 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
DKK2Q9UBU2 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
DKK2Q9UBU2 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
DKK2Q9UBU2 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC13.59□□□□□ -0.23
DKK2Q9UBU2 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
DKK2Q9UBU2 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
DKK2Q9UBU2 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
DKK2Q9UBU2 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
DKK2Q9UBU2 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
DKK2Q9UBU2 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
DKK2Q9UBU2 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
DKK2Q9UBU2 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
DKK2Q9UBU2 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
DKK2Q9UBU2 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
DKK2Q9UBU2 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
DKK2Q9UBU2 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
DKK2Q9UBU2 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
DKK2Q9UBU2 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
DKK2Q9UBU2 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
DKK2Q9UBU2 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
DKK2Q9UBU2 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
DKK2Q9UBU2 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
DKK2Q9UBU2 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
DKK2Q9UBU2 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
DKK2Q9UBU2 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
DKK2Q9UBU2 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
DKK2Q9UBU2 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
DKK2Q9UBU2 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
DKK2Q9UBU2 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
DKK2Q9UBU2 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
DKK2Q9UBU2 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
DKK2Q9UBU2 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
DKK2Q9UBU2 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
DKK2Q9UBU2 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
DKK2Q9UBU2 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
DKK2Q9UBU2 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
DKK2Q9UBU2 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
DKK2Q9UBU2 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
DKK2Q9UBU2 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
DKK2Q9UBU2 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
DKK2Q9UBU2 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
DKK2Q9UBU2 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
DKK2Q9UBU2 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
DKK2Q9UBU2 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
DKK2Q9UBU2 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
DKK2Q9UBU2 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
DKK2Q9UBU2 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
DKK2Q9UBU2 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
DKK2Q9UBU2 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
DKK2Q9UBU2 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
DKK2Q9UBU2 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
DKK2Q9UBU2 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
DKK2Q9UBU2 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
DKK2Q9UBU2 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.8 ms