Protein–RNA interactions for Protein: Q9P275

USP36, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 36, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP36Q9P275 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
USP36Q9P275 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
USP36Q9P275 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
USP36Q9P275 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
USP36Q9P275 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
USP36Q9P275 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
USP36Q9P275 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
USP36Q9P275 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
USP36Q9P275 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
USP36Q9P275 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
USP36Q9P275 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
USP36Q9P275 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
USP36Q9P275 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
USP36Q9P275 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
USP36Q9P275 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
USP36Q9P275 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
USP36Q9P275 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
USP36Q9P275 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
USP36Q9P275 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
USP36Q9P275 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
USP36Q9P275 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
USP36Q9P275 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
USP36Q9P275 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
USP36Q9P275 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
USP36Q9P275 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
USP36Q9P275 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
USP36Q9P275 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
USP36Q9P275 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
USP36Q9P275 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
USP36Q9P275 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
USP36Q9P275 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
USP36Q9P275 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
USP36Q9P275 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
USP36Q9P275 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
USP36Q9P275 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
USP36Q9P275 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
USP36Q9P275 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
USP36Q9P275 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
USP36Q9P275 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
USP36Q9P275 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
USP36Q9P275 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
USP36Q9P275 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
USP36Q9P275 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
USP36Q9P275 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
USP36Q9P275 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
USP36Q9P275 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
USP36Q9P275 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
USP36Q9P275 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
USP36Q9P275 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
USP36Q9P275 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
USP36Q9P275 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
USP36Q9P275 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
USP36Q9P275 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
USP36Q9P275 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
USP36Q9P275 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
USP36Q9P275 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
USP36Q9P275 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
USP36Q9P275 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
USP36Q9P275 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
USP36Q9P275 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
USP36Q9P275 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
USP36Q9P275 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
USP36Q9P275 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
USP36Q9P275 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
USP36Q9P275 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
USP36Q9P275 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
USP36Q9P275 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
USP36Q9P275 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
USP36Q9P275 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
USP36Q9P275 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
USP36Q9P275 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
USP36Q9P275 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
USP36Q9P275 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
USP36Q9P275 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
USP36Q9P275 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
USP36Q9P275 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
USP36Q9P275 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
USP36Q9P275 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
USP36Q9P275 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
USP36Q9P275 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
USP36Q9P275 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
USP36Q9P275 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
USP36Q9P275 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
USP36Q9P275 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
USP36Q9P275 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
USP36Q9P275 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
USP36Q9P275 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
USP36Q9P275 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
USP36Q9P275 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
USP36Q9P275 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
USP36Q9P275 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
USP36Q9P275 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
USP36Q9P275 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
USP36Q9P275 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
USP36Q9P275 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
USP36Q9P275 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
USP36Q9P275 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
USP36Q9P275 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
USP36Q9P275 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
USP36Q9P275 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms