Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0L0

VAPA, Vesicle-associated membrane protein-associated protein A, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAPAQ9P0L0 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VAPAQ9P0L0 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
VAPAQ9P0L0 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
VAPAQ9P0L0 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
VAPAQ9P0L0 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
VAPAQ9P0L0 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
VAPAQ9P0L0 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
VAPAQ9P0L0 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
VAPAQ9P0L0 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VAPAQ9P0L0 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VAPAQ9P0L0 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VAPAQ9P0L0 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VAPAQ9P0L0 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VAPAQ9P0L0 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VAPAQ9P0L0 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
VAPAQ9P0L0 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VAPAQ9P0L0 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
VAPAQ9P0L0 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VAPAQ9P0L0 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VAPAQ9P0L0 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
VAPAQ9P0L0 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VAPAQ9P0L0 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VAPAQ9P0L0 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VAPAQ9P0L0 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VAPAQ9P0L0 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VAPAQ9P0L0 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VAPAQ9P0L0 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VAPAQ9P0L0 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VAPAQ9P0L0 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
VAPAQ9P0L0 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
VAPAQ9P0L0 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VAPAQ9P0L0 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VAPAQ9P0L0 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
VAPAQ9P0L0 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VAPAQ9P0L0 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VAPAQ9P0L0 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
VAPAQ9P0L0 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VAPAQ9P0L0 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VAPAQ9P0L0 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VAPAQ9P0L0 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VAPAQ9P0L0 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
VAPAQ9P0L0 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
VAPAQ9P0L0 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
VAPAQ9P0L0 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
VAPAQ9P0L0 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
VAPAQ9P0L0 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
VAPAQ9P0L0 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VAPAQ9P0L0 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
VAPAQ9P0L0 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
VAPAQ9P0L0 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VAPAQ9P0L0 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VAPAQ9P0L0 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
VAPAQ9P0L0 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VAPAQ9P0L0 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VAPAQ9P0L0 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VAPAQ9P0L0 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
VAPAQ9P0L0 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VAPAQ9P0L0 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VAPAQ9P0L0 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
VAPAQ9P0L0 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VAPAQ9P0L0 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VAPAQ9P0L0 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VAPAQ9P0L0 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VAPAQ9P0L0 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VAPAQ9P0L0 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VAPAQ9P0L0 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
VAPAQ9P0L0 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
VAPAQ9P0L0 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VAPAQ9P0L0 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VAPAQ9P0L0 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
VAPAQ9P0L0 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
VAPAQ9P0L0 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
VAPAQ9P0L0 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
VAPAQ9P0L0 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
VAPAQ9P0L0 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VAPAQ9P0L0 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
VAPAQ9P0L0 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VAPAQ9P0L0 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VAPAQ9P0L0 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VAPAQ9P0L0 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
VAPAQ9P0L0 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
VAPAQ9P0L0 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
VAPAQ9P0L0 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
VAPAQ9P0L0 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VAPAQ9P0L0 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VAPAQ9P0L0 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VAPAQ9P0L0 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
VAPAQ9P0L0 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VAPAQ9P0L0 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VAPAQ9P0L0 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VAPAQ9P0L0 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
VAPAQ9P0L0 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
VAPAQ9P0L0 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
VAPAQ9P0L0 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
VAPAQ9P0L0 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VAPAQ9P0L0 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VAPAQ9P0L0 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VAPAQ9P0L0 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VAPAQ9P0L0 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VAPAQ9P0L0 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms