Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXS3

KLHL28, Kelch-like protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL28Q9NXS3 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
KLHL28Q9NXS3 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL28Q9NXS3 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL28Q9NXS3 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL28Q9NXS3 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL28Q9NXS3 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL28Q9NXS3 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL28Q9NXS3 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL28Q9NXS3 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL28Q9NXS3 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL28Q9NXS3 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL28Q9NXS3 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL28Q9NXS3 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL28Q9NXS3 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL28Q9NXS3 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL28Q9NXS3 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL28Q9NXS3 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL28Q9NXS3 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL28Q9NXS3 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL28Q9NXS3 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL28Q9NXS3 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL28Q9NXS3 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL28Q9NXS3 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL28Q9NXS3 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL28Q9NXS3 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL28Q9NXS3 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL28Q9NXS3 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL28Q9NXS3 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL28Q9NXS3 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL28Q9NXS3 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL28Q9NXS3 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL28Q9NXS3 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL28Q9NXS3 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL28Q9NXS3 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL28Q9NXS3 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL28Q9NXS3 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL28Q9NXS3 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL28Q9NXS3 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL28Q9NXS3 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL28Q9NXS3 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL28Q9NXS3 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC17■□□□□ 0.31
KLHL28Q9NXS3 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL28Q9NXS3 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL28Q9NXS3 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL28Q9NXS3 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL28Q9NXS3 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL28Q9NXS3 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC17■□□□□ 0.31
KLHL28Q9NXS3 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL28Q9NXS3 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL28Q9NXS3 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL28Q9NXS3 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC17■□□□□ 0.31
KLHL28Q9NXS3 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL28Q9NXS3 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL28Q9NXS3 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL28Q9NXS3 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL28Q9NXS3 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL28Q9NXS3 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
KLHL28Q9NXS3 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLHL28Q9NXS3 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLHL28Q9NXS3 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLHL28Q9NXS3 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLHL28Q9NXS3 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLHL28Q9NXS3 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLHL28Q9NXS3 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLHL28Q9NXS3 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLHL28Q9NXS3 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLHL28Q9NXS3 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLHL28Q9NXS3 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLHL28Q9NXS3 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLHL28Q9NXS3 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
KLHL28Q9NXS3 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLHL28Q9NXS3 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLHL28Q9NXS3 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLHL28Q9NXS3 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLHL28Q9NXS3 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLHL28Q9NXS3 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLHL28Q9NXS3 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLHL28Q9NXS3 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLHL28Q9NXS3 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLHL28Q9NXS3 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLHL28Q9NXS3 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLHL28Q9NXS3 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLHL28Q9NXS3 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KLHL28Q9NXS3 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KLHL28Q9NXS3 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KLHL28Q9NXS3 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KLHL28Q9NXS3 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KLHL28Q9NXS3 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KLHL28Q9NXS3 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KLHL28Q9NXS3 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KLHL28Q9NXS3 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KLHL28Q9NXS3 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KLHL28Q9NXS3 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
KLHL28Q9NXS3 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KLHL28Q9NXS3 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KLHL28Q9NXS3 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KLHL28Q9NXS3 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KLHL28Q9NXS3 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KLHL28Q9NXS3 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
KLHL28Q9NXS3 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms