Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRB3

CHST12, Carbohydrate sulfotransferase 12, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHST12Q9NRB3 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CHST12Q9NRB3 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CHST12Q9NRB3 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CHST12Q9NRB3 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CHST12Q9NRB3 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CHST12Q9NRB3 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CHST12Q9NRB3 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
CHST12Q9NRB3 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CHST12Q9NRB3 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CHST12Q9NRB3 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CHST12Q9NRB3 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CHST12Q9NRB3 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CHST12Q9NRB3 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
CHST12Q9NRB3 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CHST12Q9NRB3 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CHST12Q9NRB3 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CHST12Q9NRB3 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CHST12Q9NRB3 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CHST12Q9NRB3 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CHST12Q9NRB3 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CHST12Q9NRB3 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CHST12Q9NRB3 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CHST12Q9NRB3 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
CHST12Q9NRB3 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
CHST12Q9NRB3 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.74
CHST12Q9NRB3 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
CHST12Q9NRB3 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CHST12Q9NRB3 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
CHST12Q9NRB3 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CHST12Q9NRB3 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CHST12Q9NRB3 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CHST12Q9NRB3 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CHST12Q9NRB3 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
CHST12Q9NRB3 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CHST12Q9NRB3 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CHST12Q9NRB3 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CHST12Q9NRB3 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CHST12Q9NRB3 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CHST12Q9NRB3 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CHST12Q9NRB3 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CHST12Q9NRB3 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CHST12Q9NRB3 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CHST12Q9NRB3 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CHST12Q9NRB3 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CHST12Q9NRB3 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
CHST12Q9NRB3 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CHST12Q9NRB3 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CHST12Q9NRB3 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CHST12Q9NRB3 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CHST12Q9NRB3 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
CHST12Q9NRB3 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CHST12Q9NRB3 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CHST12Q9NRB3 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CHST12Q9NRB3 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CHST12Q9NRB3 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CHST12Q9NRB3 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CHST12Q9NRB3 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CHST12Q9NRB3 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CHST12Q9NRB3 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CHST12Q9NRB3 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CHST12Q9NRB3 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CHST12Q9NRB3 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CHST12Q9NRB3 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CHST12Q9NRB3 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CHST12Q9NRB3 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CHST12Q9NRB3 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CHST12Q9NRB3 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CHST12Q9NRB3 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CHST12Q9NRB3 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CHST12Q9NRB3 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CHST12Q9NRB3 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CHST12Q9NRB3 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CHST12Q9NRB3 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CHST12Q9NRB3 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CHST12Q9NRB3 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CHST12Q9NRB3 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CHST12Q9NRB3 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CHST12Q9NRB3 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CHST12Q9NRB3 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CHST12Q9NRB3 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CHST12Q9NRB3 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CHST12Q9NRB3 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
CHST12Q9NRB3 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CHST12Q9NRB3 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CHST12Q9NRB3 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CHST12Q9NRB3 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CHST12Q9NRB3 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
CHST12Q9NRB3 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CHST12Q9NRB3 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CHST12Q9NRB3 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CHST12Q9NRB3 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CHST12Q9NRB3 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CHST12Q9NRB3 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CHST12Q9NRB3 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CHST12Q9NRB3 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CHST12Q9NRB3 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CHST12Q9NRB3 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CHST12Q9NRB3 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CHST12Q9NRB3 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CHST12Q9NRB3 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms