Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPI8

FANCF, Fanconi anemia group F protein, humanhuman

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Length 374 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCFQ9NPI8 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FANCFQ9NPI8 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FANCFQ9NPI8 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FANCFQ9NPI8 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
FANCFQ9NPI8 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FANCFQ9NPI8 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FANCFQ9NPI8 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FANCFQ9NPI8 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FANCFQ9NPI8 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FANCFQ9NPI8 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FANCFQ9NPI8 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FANCFQ9NPI8 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FANCFQ9NPI8 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FANCFQ9NPI8 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FANCFQ9NPI8 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FANCFQ9NPI8 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FANCFQ9NPI8 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FANCFQ9NPI8 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FANCFQ9NPI8 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FANCFQ9NPI8 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FANCFQ9NPI8 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FANCFQ9NPI8 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FANCFQ9NPI8 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FANCFQ9NPI8 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FANCFQ9NPI8 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FANCFQ9NPI8 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FANCFQ9NPI8 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FANCFQ9NPI8 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FANCFQ9NPI8 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FANCFQ9NPI8 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FANCFQ9NPI8 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FANCFQ9NPI8 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FANCFQ9NPI8 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FANCFQ9NPI8 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FANCFQ9NPI8 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FANCFQ9NPI8 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FANCFQ9NPI8 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FANCFQ9NPI8 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FANCFQ9NPI8 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FANCFQ9NPI8 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FANCFQ9NPI8 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FANCFQ9NPI8 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FANCFQ9NPI8 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FANCFQ9NPI8 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FANCFQ9NPI8 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FANCFQ9NPI8 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FANCFQ9NPI8 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
FANCFQ9NPI8 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FANCFQ9NPI8 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FANCFQ9NPI8 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FANCFQ9NPI8 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FANCFQ9NPI8 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FANCFQ9NPI8 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FANCFQ9NPI8 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FANCFQ9NPI8 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FANCFQ9NPI8 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FANCFQ9NPI8 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FANCFQ9NPI8 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FANCFQ9NPI8 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FANCFQ9NPI8 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FANCFQ9NPI8 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FANCFQ9NPI8 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FANCFQ9NPI8 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FANCFQ9NPI8 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FANCFQ9NPI8 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FANCFQ9NPI8 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FANCFQ9NPI8 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FANCFQ9NPI8 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FANCFQ9NPI8 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FANCFQ9NPI8 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FANCFQ9NPI8 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FANCFQ9NPI8 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FANCFQ9NPI8 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FANCFQ9NPI8 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FANCFQ9NPI8 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
FANCFQ9NPI8 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FANCFQ9NPI8 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FANCFQ9NPI8 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FANCFQ9NPI8 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FANCFQ9NPI8 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FANCFQ9NPI8 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FANCFQ9NPI8 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FANCFQ9NPI8 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FANCFQ9NPI8 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FANCFQ9NPI8 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FANCFQ9NPI8 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FANCFQ9NPI8 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FANCFQ9NPI8 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FANCFQ9NPI8 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FANCFQ9NPI8 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FANCFQ9NPI8 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FANCFQ9NPI8 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FANCFQ9NPI8 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FANCFQ9NPI8 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FANCFQ9NPI8 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FANCFQ9NPI8 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FANCFQ9NPI8 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FANCFQ9NPI8 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FANCFQ9NPI8 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FANCFQ9NPI8 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
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