Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZT6

CCDC90B, Coiled-coil domain-containing protein 90B, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC90BQ9GZT6 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC90BQ9GZT6 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC90BQ9GZT6 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC90BQ9GZT6 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC90BQ9GZT6 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC90BQ9GZT6 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC90BQ9GZT6 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC90BQ9GZT6 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC90BQ9GZT6 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC90BQ9GZT6 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC90BQ9GZT6 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC90BQ9GZT6 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC90BQ9GZT6 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC90BQ9GZT6 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC90BQ9GZT6 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC90BQ9GZT6 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC90BQ9GZT6 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC90BQ9GZT6 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC90BQ9GZT6 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC90BQ9GZT6 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC90BQ9GZT6 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC90BQ9GZT6 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC90BQ9GZT6 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC90BQ9GZT6 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC90BQ9GZT6 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC90BQ9GZT6 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC90BQ9GZT6 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC90BQ9GZT6 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC90BQ9GZT6 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC90BQ9GZT6 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC90BQ9GZT6 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC90BQ9GZT6 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC90BQ9GZT6 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC90BQ9GZT6 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC90BQ9GZT6 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC90BQ9GZT6 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC90BQ9GZT6 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC90BQ9GZT6 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC90BQ9GZT6 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC90BQ9GZT6 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC90BQ9GZT6 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC90BQ9GZT6 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC90BQ9GZT6 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC90BQ9GZT6 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC90BQ9GZT6 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC90BQ9GZT6 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC90BQ9GZT6 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC90BQ9GZT6 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC90BQ9GZT6 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC90BQ9GZT6 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC90BQ9GZT6 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC90BQ9GZT6 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC90BQ9GZT6 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC90BQ9GZT6 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC90BQ9GZT6 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC90BQ9GZT6 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC90BQ9GZT6 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC90BQ9GZT6 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC90BQ9GZT6 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC90BQ9GZT6 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC90BQ9GZT6 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC90BQ9GZT6 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC90BQ9GZT6 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC90BQ9GZT6 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC90BQ9GZT6 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC90BQ9GZT6 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC90BQ9GZT6 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC90BQ9GZT6 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC90BQ9GZT6 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC90BQ9GZT6 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC90BQ9GZT6 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC90BQ9GZT6 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC90BQ9GZT6 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC90BQ9GZT6 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC90BQ9GZT6 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC90BQ9GZT6 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC90BQ9GZT6 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC90BQ9GZT6 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC90BQ9GZT6 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC90BQ9GZT6 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC90BQ9GZT6 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC90BQ9GZT6 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC90BQ9GZT6 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC90BQ9GZT6 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC90BQ9GZT6 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC90BQ9GZT6 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC90BQ9GZT6 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC90BQ9GZT6 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC90BQ9GZT6 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC90BQ9GZT6 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC90BQ9GZT6 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC90BQ9GZT6 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC90BQ9GZT6 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC90BQ9GZT6 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC90BQ9GZT6 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC90BQ9GZT6 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC90BQ9GZT6 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC90BQ9GZT6 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC90BQ9GZT6 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC90BQ9GZT6 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms