Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZP0

PDGFD, Platelet-derived growth factor D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 370 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFDQ9GZP0 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDGFDQ9GZP0 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDGFDQ9GZP0 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDGFDQ9GZP0 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDGFDQ9GZP0 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDGFDQ9GZP0 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDGFDQ9GZP0 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDGFDQ9GZP0 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDGFDQ9GZP0 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDGFDQ9GZP0 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDGFDQ9GZP0 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDGFDQ9GZP0 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDGFDQ9GZP0 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDGFDQ9GZP0 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDGFDQ9GZP0 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDGFDQ9GZP0 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDGFDQ9GZP0 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDGFDQ9GZP0 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDGFDQ9GZP0 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDGFDQ9GZP0 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDGFDQ9GZP0 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDGFDQ9GZP0 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDGFDQ9GZP0 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDGFDQ9GZP0 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDGFDQ9GZP0 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDGFDQ9GZP0 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDGFDQ9GZP0 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDGFDQ9GZP0 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDGFDQ9GZP0 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDGFDQ9GZP0 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDGFDQ9GZP0 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDGFDQ9GZP0 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDGFDQ9GZP0 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDGFDQ9GZP0 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDGFDQ9GZP0 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDGFDQ9GZP0 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDGFDQ9GZP0 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PDGFDQ9GZP0 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDGFDQ9GZP0 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDGFDQ9GZP0 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDGFDQ9GZP0 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDGFDQ9GZP0 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDGFDQ9GZP0 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PDGFDQ9GZP0 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDGFDQ9GZP0 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDGFDQ9GZP0 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDGFDQ9GZP0 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDGFDQ9GZP0 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDGFDQ9GZP0 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDGFDQ9GZP0 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDGFDQ9GZP0 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDGFDQ9GZP0 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PDGFDQ9GZP0 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PDGFDQ9GZP0 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDGFDQ9GZP0 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDGFDQ9GZP0 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDGFDQ9GZP0 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDGFDQ9GZP0 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDGFDQ9GZP0 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDGFDQ9GZP0 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PDGFDQ9GZP0 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDGFDQ9GZP0 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDGFDQ9GZP0 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDGFDQ9GZP0 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDGFDQ9GZP0 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDGFDQ9GZP0 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDGFDQ9GZP0 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDGFDQ9GZP0 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDGFDQ9GZP0 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDGFDQ9GZP0 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDGFDQ9GZP0 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDGFDQ9GZP0 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDGFDQ9GZP0 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PDGFDQ9GZP0 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PDGFDQ9GZP0 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PDGFDQ9GZP0 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDGFDQ9GZP0 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDGFDQ9GZP0 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDGFDQ9GZP0 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDGFDQ9GZP0 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PDGFDQ9GZP0 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PDGFDQ9GZP0 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDGFDQ9GZP0 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDGFDQ9GZP0 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDGFDQ9GZP0 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PDGFDQ9GZP0 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PDGFDQ9GZP0 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDGFDQ9GZP0 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDGFDQ9GZP0 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDGFDQ9GZP0 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDGFDQ9GZP0 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDGFDQ9GZP0 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDGFDQ9GZP0 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDGFDQ9GZP0 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDGFDQ9GZP0 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PDGFDQ9GZP0 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDGFDQ9GZP0 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PDGFDQ9GZP0 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PDGFDQ9GZP0 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDGFDQ9GZP0 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
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