Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY60

GABARAPL3, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPL3Q9BY60 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
GABARAPL3Q9BY60 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GABARAPL3Q9BY60 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GABARAPL3Q9BY60 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GABARAPL3Q9BY60 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GABARAPL3Q9BY60 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GABARAPL3Q9BY60 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GABARAPL3Q9BY60 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
GABARAPL3Q9BY60 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GABARAPL3Q9BY60 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
GABARAPL3Q9BY60 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GABARAPL3Q9BY60 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GABARAPL3Q9BY60 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GABARAPL3Q9BY60 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GABARAPL3Q9BY60 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GABARAPL3Q9BY60 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GABARAPL3Q9BY60 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GABARAPL3Q9BY60 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GABARAPL3Q9BY60 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GABARAPL3Q9BY60 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GABARAPL3Q9BY60 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GABARAPL3Q9BY60 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GABARAPL3Q9BY60 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GABARAPL3Q9BY60 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GABARAPL3Q9BY60 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GABARAPL3Q9BY60 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GABARAPL3Q9BY60 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GABARAPL3Q9BY60 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GABARAPL3Q9BY60 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GABARAPL3Q9BY60 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GABARAPL3Q9BY60 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GABARAPL3Q9BY60 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GABARAPL3Q9BY60 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GABARAPL3Q9BY60 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GABARAPL3Q9BY60 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GABARAPL3Q9BY60 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GABARAPL3Q9BY60 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GABARAPL3Q9BY60 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
GABARAPL3Q9BY60 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
GABARAPL3Q9BY60 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GABARAPL3Q9BY60 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GABARAPL3Q9BY60 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
GABARAPL3Q9BY60 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GABARAPL3Q9BY60 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
GABARAPL3Q9BY60 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GABARAPL3Q9BY60 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GABARAPL3Q9BY60 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GABARAPL3Q9BY60 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GABARAPL3Q9BY60 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GABARAPL3Q9BY60 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GABARAPL3Q9BY60 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GABARAPL3Q9BY60 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GABARAPL3Q9BY60 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GABARAPL3Q9BY60 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GABARAPL3Q9BY60 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GABARAPL3Q9BY60 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GABARAPL3Q9BY60 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GABARAPL3Q9BY60 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GABARAPL3Q9BY60 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GABARAPL3Q9BY60 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GABARAPL3Q9BY60 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GABARAPL3Q9BY60 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GABARAPL3Q9BY60 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GABARAPL3Q9BY60 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GABARAPL3Q9BY60 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GABARAPL3Q9BY60 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GABARAPL3Q9BY60 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GABARAPL3Q9BY60 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GABARAPL3Q9BY60 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GABARAPL3Q9BY60 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GABARAPL3Q9BY60 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GABARAPL3Q9BY60 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GABARAPL3Q9BY60 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GABARAPL3Q9BY60 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GABARAPL3Q9BY60 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GABARAPL3Q9BY60 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GABARAPL3Q9BY60 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GABARAPL3Q9BY60 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GABARAPL3Q9BY60 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GABARAPL3Q9BY60 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GABARAPL3Q9BY60 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GABARAPL3Q9BY60 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GABARAPL3Q9BY60 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GABARAPL3Q9BY60 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GABARAPL3Q9BY60 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GABARAPL3Q9BY60 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GABARAPL3Q9BY60 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GABARAPL3Q9BY60 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GABARAPL3Q9BY60 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GABARAPL3Q9BY60 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GABARAPL3Q9BY60 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GABARAPL3Q9BY60 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GABARAPL3Q9BY60 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GABARAPL3Q9BY60 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GABARAPL3Q9BY60 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GABARAPL3Q9BY60 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GABARAPL3Q9BY60 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GABARAPL3Q9BY60 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GABARAPL3Q9BY60 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GABARAPL3Q9BY60 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms