Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQW3

EBF4, Transcription factor COE4, humanhuman

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBF4Q9BQW3 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
EBF4Q9BQW3 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
EBF4Q9BQW3 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
EBF4Q9BQW3 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
EBF4Q9BQW3 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
EBF4Q9BQW3 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
EBF4Q9BQW3 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
EBF4Q9BQW3 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
EBF4Q9BQW3 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
EBF4Q9BQW3 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
EBF4Q9BQW3 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
EBF4Q9BQW3 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
EBF4Q9BQW3 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
EBF4Q9BQW3 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
EBF4Q9BQW3 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
EBF4Q9BQW3 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
EBF4Q9BQW3 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
EBF4Q9BQW3 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
EBF4Q9BQW3 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
EBF4Q9BQW3 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
EBF4Q9BQW3 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EBF4Q9BQW3 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EBF4Q9BQW3 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EBF4Q9BQW3 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EBF4Q9BQW3 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EBF4Q9BQW3 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EBF4Q9BQW3 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
EBF4Q9BQW3 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
EBF4Q9BQW3 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
EBF4Q9BQW3 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
EBF4Q9BQW3 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
EBF4Q9BQW3 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EBF4Q9BQW3 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
EBF4Q9BQW3 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
EBF4Q9BQW3 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
EBF4Q9BQW3 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EBF4Q9BQW3 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
EBF4Q9BQW3 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EBF4Q9BQW3 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
EBF4Q9BQW3 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
EBF4Q9BQW3 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EBF4Q9BQW3 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EBF4Q9BQW3 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
EBF4Q9BQW3 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
EBF4Q9BQW3 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EBF4Q9BQW3 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
EBF4Q9BQW3 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
EBF4Q9BQW3 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
EBF4Q9BQW3 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
EBF4Q9BQW3 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
EBF4Q9BQW3 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
EBF4Q9BQW3 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
EBF4Q9BQW3 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
EBF4Q9BQW3 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
EBF4Q9BQW3 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
EBF4Q9BQW3 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
EBF4Q9BQW3 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
EBF4Q9BQW3 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
EBF4Q9BQW3 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
EBF4Q9BQW3 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
EBF4Q9BQW3 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
EBF4Q9BQW3 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
EBF4Q9BQW3 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
EBF4Q9BQW3 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
EBF4Q9BQW3 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
EBF4Q9BQW3 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
EBF4Q9BQW3 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
EBF4Q9BQW3 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
EBF4Q9BQW3 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
EBF4Q9BQW3 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
EBF4Q9BQW3 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
EBF4Q9BQW3 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
EBF4Q9BQW3 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
EBF4Q9BQW3 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
EBF4Q9BQW3 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
EBF4Q9BQW3 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
EBF4Q9BQW3 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
EBF4Q9BQW3 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
EBF4Q9BQW3 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
EBF4Q9BQW3 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
EBF4Q9BQW3 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
EBF4Q9BQW3 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
EBF4Q9BQW3 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
EBF4Q9BQW3 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
EBF4Q9BQW3 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
EBF4Q9BQW3 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
EBF4Q9BQW3 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
EBF4Q9BQW3 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
EBF4Q9BQW3 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
EBF4Q9BQW3 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
EBF4Q9BQW3 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
EBF4Q9BQW3 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
EBF4Q9BQW3 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
EBF4Q9BQW3 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
EBF4Q9BQW3 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
EBF4Q9BQW3 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
EBF4Q9BQW3 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
EBF4Q9BQW3 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
EBF4Q9BQW3 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
EBF4Q9BQW3 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms