Protein–RNA interactions for Protein: Q96SW2

CRBN, Protein cereblon, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRBNQ96SW2 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CRBNQ96SW2 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CRBNQ96SW2 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CRBNQ96SW2 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CRBNQ96SW2 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CRBNQ96SW2 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CRBNQ96SW2 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CRBNQ96SW2 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CRBNQ96SW2 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CRBNQ96SW2 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CRBNQ96SW2 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CRBNQ96SW2 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CRBNQ96SW2 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CRBNQ96SW2 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CRBNQ96SW2 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CRBNQ96SW2 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CRBNQ96SW2 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CRBNQ96SW2 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CRBNQ96SW2 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CRBNQ96SW2 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CRBNQ96SW2 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CRBNQ96SW2 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CRBNQ96SW2 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CRBNQ96SW2 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CRBNQ96SW2 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CRBNQ96SW2 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CRBNQ96SW2 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CRBNQ96SW2 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CRBNQ96SW2 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CRBNQ96SW2 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CRBNQ96SW2 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CRBNQ96SW2 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CRBNQ96SW2 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CRBNQ96SW2 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CRBNQ96SW2 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CRBNQ96SW2 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CRBNQ96SW2 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CRBNQ96SW2 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CRBNQ96SW2 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CRBNQ96SW2 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CRBNQ96SW2 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CRBNQ96SW2 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CRBNQ96SW2 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CRBNQ96SW2 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CRBNQ96SW2 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CRBNQ96SW2 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CRBNQ96SW2 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CRBNQ96SW2 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CRBNQ96SW2 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CRBNQ96SW2 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CRBNQ96SW2 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CRBNQ96SW2 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CRBNQ96SW2 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CRBNQ96SW2 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CRBNQ96SW2 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CRBNQ96SW2 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CRBNQ96SW2 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CRBNQ96SW2 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CRBNQ96SW2 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CRBNQ96SW2 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CRBNQ96SW2 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CRBNQ96SW2 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CRBNQ96SW2 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CRBNQ96SW2 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CRBNQ96SW2 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CRBNQ96SW2 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CRBNQ96SW2 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CRBNQ96SW2 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CRBNQ96SW2 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CRBNQ96SW2 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CRBNQ96SW2 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CRBNQ96SW2 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CRBNQ96SW2 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CRBNQ96SW2 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CRBNQ96SW2 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CRBNQ96SW2 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CRBNQ96SW2 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CRBNQ96SW2 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CRBNQ96SW2 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CRBNQ96SW2 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CRBNQ96SW2 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CRBNQ96SW2 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CRBNQ96SW2 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CRBNQ96SW2 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CRBNQ96SW2 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CRBNQ96SW2 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CRBNQ96SW2 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CRBNQ96SW2 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CRBNQ96SW2 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CRBNQ96SW2 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CRBNQ96SW2 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CRBNQ96SW2 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CRBNQ96SW2 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CRBNQ96SW2 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CRBNQ96SW2 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CRBNQ96SW2 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CRBNQ96SW2 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CRBNQ96SW2 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CRBNQ96SW2 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CRBNQ96SW2 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms