Protein–RNA interactions for Protein: Q96PN7

TRERF1, Transcriptional-regulating factor 1, humanhuman

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Length 1,200 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRERF1Q96PN7 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRERF1Q96PN7 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRERF1Q96PN7 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRERF1Q96PN7 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRERF1Q96PN7 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRERF1Q96PN7 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRERF1Q96PN7 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRERF1Q96PN7 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRERF1Q96PN7 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRERF1Q96PN7 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRERF1Q96PN7 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRERF1Q96PN7 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRERF1Q96PN7 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
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TRERF1Q96PN7 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRERF1Q96PN7 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRERF1Q96PN7 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
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TRERF1Q96PN7 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRERF1Q96PN7 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
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TRERF1Q96PN7 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRERF1Q96PN7 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRERF1Q96PN7 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRERF1Q96PN7 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRERF1Q96PN7 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
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TRERF1Q96PN7 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
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TRERF1Q96PN7 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
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TRERF1Q96PN7 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
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TRERF1Q96PN7 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRERF1Q96PN7 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRERF1Q96PN7 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRERF1Q96PN7 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRERF1Q96PN7 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRERF1Q96PN7 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRERF1Q96PN7 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRERF1Q96PN7 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRERF1Q96PN7 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRERF1Q96PN7 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
TRERF1Q96PN7 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRERF1Q96PN7 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRERF1Q96PN7 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
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