Protein–RNA interactions for Protein: Q96M60

FAM227B, Protein FAM227B, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM227BQ96M60 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FAM227BQ96M60 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FAM227BQ96M60 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FAM227BQ96M60 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FAM227BQ96M60 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FAM227BQ96M60 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
FAM227BQ96M60 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FAM227BQ96M60 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FAM227BQ96M60 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FAM227BQ96M60 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FAM227BQ96M60 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FAM227BQ96M60 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FAM227BQ96M60 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
FAM227BQ96M60 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
FAM227BQ96M60 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
FAM227BQ96M60 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FAM227BQ96M60 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FAM227BQ96M60 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FAM227BQ96M60 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FAM227BQ96M60 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
FAM227BQ96M60 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FAM227BQ96M60 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FAM227BQ96M60 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FAM227BQ96M60 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FAM227BQ96M60 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FAM227BQ96M60 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FAM227BQ96M60 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FAM227BQ96M60 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FAM227BQ96M60 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FAM227BQ96M60 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FAM227BQ96M60 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FAM227BQ96M60 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FAM227BQ96M60 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FAM227BQ96M60 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FAM227BQ96M60 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FAM227BQ96M60 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FAM227BQ96M60 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
FAM227BQ96M60 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FAM227BQ96M60 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
FAM227BQ96M60 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FAM227BQ96M60 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FAM227BQ96M60 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FAM227BQ96M60 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FAM227BQ96M60 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FAM227BQ96M60 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FAM227BQ96M60 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FAM227BQ96M60 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FAM227BQ96M60 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FAM227BQ96M60 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FAM227BQ96M60 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FAM227BQ96M60 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FAM227BQ96M60 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
FAM227BQ96M60 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
FAM227BQ96M60 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
FAM227BQ96M60 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
FAM227BQ96M60 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
FAM227BQ96M60 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
FAM227BQ96M60 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
FAM227BQ96M60 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
FAM227BQ96M60 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
FAM227BQ96M60 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
FAM227BQ96M60 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
FAM227BQ96M60 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
FAM227BQ96M60 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
FAM227BQ96M60 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
FAM227BQ96M60 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
FAM227BQ96M60 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
FAM227BQ96M60 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
FAM227BQ96M60 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
FAM227BQ96M60 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
FAM227BQ96M60 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
FAM227BQ96M60 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
FAM227BQ96M60 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
FAM227BQ96M60 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
FAM227BQ96M60 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
FAM227BQ96M60 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
FAM227BQ96M60 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
FAM227BQ96M60 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
FAM227BQ96M60 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
FAM227BQ96M60 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
FAM227BQ96M60 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FAM227BQ96M60 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FAM227BQ96M60 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FAM227BQ96M60 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FAM227BQ96M60 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FAM227BQ96M60 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FAM227BQ96M60 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FAM227BQ96M60 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FAM227BQ96M60 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FAM227BQ96M60 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FAM227BQ96M60 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FAM227BQ96M60 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FAM227BQ96M60 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FAM227BQ96M60 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FAM227BQ96M60 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FAM227BQ96M60 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
FAM227BQ96M60 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
FAM227BQ96M60 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
FAM227BQ96M60 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FAM227BQ96M60 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms