Protein–RNA interactions for Protein: Q96L91

EP400, E1A-binding protein p400, humanhuman

Predictions only

Length 3,159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EP400Q96L91 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
EP400Q96L91 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
EP400Q96L91 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
EP400Q96L91 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
EP400Q96L91 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
EP400Q96L91 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
EP400Q96L91 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
EP400Q96L91 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
EP400Q96L91 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
EP400Q96L91 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
EP400Q96L91 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
EP400Q96L91 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
EP400Q96L91 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
EP400Q96L91 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
EP400Q96L91 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
EP400Q96L91 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
EP400Q96L91 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
EP400Q96L91 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.35
EP400Q96L91 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
EP400Q96L91 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
EP400Q96L91 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
EP400Q96L91 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
EP400Q96L91 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
EP400Q96L91 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
EP400Q96L91 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
EP400Q96L91 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
EP400Q96L91 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
EP400Q96L91 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
EP400Q96L91 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
EP400Q96L91 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EP400Q96L91 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
EP400Q96L91 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EP400Q96L91 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
EP400Q96L91 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EP400Q96L91 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
EP400Q96L91 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EP400Q96L91 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EP400Q96L91 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
EP400Q96L91 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EP400Q96L91 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
EP400Q96L91 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
EP400Q96L91 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
EP400Q96L91 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
EP400Q96L91 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
EP400Q96L91 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EP400Q96L91 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EP400Q96L91 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EP400Q96L91 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EP400Q96L91 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
EP400Q96L91 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
EP400Q96L91 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EP400Q96L91 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EP400Q96L91 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EP400Q96L91 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EP400Q96L91 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EP400Q96L91 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EP400Q96L91 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EP400Q96L91 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EP400Q96L91 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EP400Q96L91 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EP400Q96L91 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EP400Q96L91 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
EP400Q96L91 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EP400Q96L91 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EP400Q96L91 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
EP400Q96L91 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EP400Q96L91 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EP400Q96L91 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EP400Q96L91 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EP400Q96L91 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
EP400Q96L91 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
EP400Q96L91 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
EP400Q96L91 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EP400Q96L91 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
EP400Q96L91 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
EP400Q96L91 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EP400Q96L91 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EP400Q96L91 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
EP400Q96L91 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
EP400Q96L91 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
EP400Q96L91 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
EP400Q96L91 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
EP400Q96L91 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
EP400Q96L91 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
EP400Q96L91 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EP400Q96L91 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EP400Q96L91 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EP400Q96L91 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EP400Q96L91 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EP400Q96L91 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
EP400Q96L91 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EP400Q96L91 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EP400Q96L91 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
EP400Q96L91 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EP400Q96L91 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EP400Q96L91 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
EP400Q96L91 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EP400Q96L91 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
EP400Q96L91 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
EP400Q96L91 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms