Protein–RNA interactions for Protein: Q969Q1

TRIM63, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM63, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM63Q969Q1 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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TRIM63Q969Q1 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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TRIM63Q969Q1 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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TRIM63Q969Q1 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM63Q969Q1 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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TRIM63Q969Q1 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
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TRIM63Q969Q1 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM63Q969Q1 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM63Q969Q1 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM63Q969Q1 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM63Q969Q1 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM63Q969Q1 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM63Q969Q1 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM63Q969Q1 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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