Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUD4

CCDC12, Coiled-coil domain-containing protein 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC12Q8WUD4 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC12Q8WUD4 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC12Q8WUD4 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC12Q8WUD4 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC12Q8WUD4 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC12Q8WUD4 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC12Q8WUD4 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC12Q8WUD4 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC12Q8WUD4 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC12Q8WUD4 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC12Q8WUD4 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC12Q8WUD4 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC12Q8WUD4 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC12Q8WUD4 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC12Q8WUD4 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC12Q8WUD4 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC12Q8WUD4 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC12Q8WUD4 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC12Q8WUD4 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC12Q8WUD4 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC12Q8WUD4 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC12Q8WUD4 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC12Q8WUD4 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC12Q8WUD4 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC12Q8WUD4 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC12Q8WUD4 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC12Q8WUD4 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC12Q8WUD4 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC12Q8WUD4 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC12Q8WUD4 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC12Q8WUD4 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC12Q8WUD4 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC12Q8WUD4 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC12Q8WUD4 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC12Q8WUD4 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC12Q8WUD4 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC12Q8WUD4 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC12Q8WUD4 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC12Q8WUD4 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC12Q8WUD4 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC12Q8WUD4 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC12Q8WUD4 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC12Q8WUD4 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC12Q8WUD4 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC12Q8WUD4 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC12Q8WUD4 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC12Q8WUD4 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC12Q8WUD4 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC12Q8WUD4 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC12Q8WUD4 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC12Q8WUD4 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC12Q8WUD4 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC12Q8WUD4 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC12Q8WUD4 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC12Q8WUD4 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC12Q8WUD4 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC12Q8WUD4 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC12Q8WUD4 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC12Q8WUD4 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC12Q8WUD4 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC12Q8WUD4 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC12Q8WUD4 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC12Q8WUD4 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC12Q8WUD4 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC12Q8WUD4 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC12Q8WUD4 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC12Q8WUD4 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC12Q8WUD4 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC12Q8WUD4 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC12Q8WUD4 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC12Q8WUD4 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC12Q8WUD4 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC12Q8WUD4 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC12Q8WUD4 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC12Q8WUD4 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC12Q8WUD4 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC12Q8WUD4 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC12Q8WUD4 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC12Q8WUD4 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC12Q8WUD4 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC12Q8WUD4 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC12Q8WUD4 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC12Q8WUD4 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC12Q8WUD4 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC12Q8WUD4 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC12Q8WUD4 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC12Q8WUD4 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC12Q8WUD4 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC12Q8WUD4 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC12Q8WUD4 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC12Q8WUD4 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC12Q8WUD4 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC12Q8WUD4 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC12Q8WUD4 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC12Q8WUD4 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC12Q8WUD4 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC12Q8WUD4 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC12Q8WUD4 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC12Q8WUD4 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC12Q8WUD4 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms